Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHH5

Cxcl11, C-X-C motif chemokine 11, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl11Q9JHH5 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cxcl11Q9JHH5 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cxcl11Q9JHH5 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cxcl11Q9JHH5 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cxcl11Q9JHH5 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cxcl11Q9JHH5 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Cxcl11Q9JHH5 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cxcl11Q9JHH5 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cxcl11Q9JHH5 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cxcl11Q9JHH5 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cxcl11Q9JHH5 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Cxcl11Q9JHH5 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cxcl11Q9JHH5 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cxcl11Q9JHH5 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cxcl11Q9JHH5 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cxcl11Q9JHH5 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cxcl11Q9JHH5 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cxcl11Q9JHH5 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cxcl11Q9JHH5 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Cxcl11Q9JHH5 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cxcl11Q9JHH5 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cxcl11Q9JHH5 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cxcl11Q9JHH5 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cxcl11Q9JHH5 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cxcl11Q9JHH5 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cxcl11Q9JHH5 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cxcl11Q9JHH5 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cxcl11Q9JHH5 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cxcl11Q9JHH5 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cxcl11Q9JHH5 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cxcl11Q9JHH5 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cxcl11Q9JHH5 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Cxcl11Q9JHH5 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Cxcl11Q9JHH5 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Cxcl11Q9JHH5 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Cxcl11Q9JHH5 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cxcl11Q9JHH5 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cxcl11Q9JHH5 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cxcl11Q9JHH5 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Cxcl11Q9JHH5 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cxcl11Q9JHH5 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cxcl11Q9JHH5 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cxcl11Q9JHH5 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cxcl11Q9JHH5 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cxcl11Q9JHH5 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Cxcl11Q9JHH5 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cxcl11Q9JHH5 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cxcl11Q9JHH5 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cxcl11Q9JHH5 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cxcl11Q9JHH5 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cxcl11Q9JHH5 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cxcl11Q9JHH5 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Cxcl11Q9JHH5 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cxcl11Q9JHH5 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cxcl11Q9JHH5 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cxcl11Q9JHH5 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Cxcl11Q9JHH5 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cxcl11Q9JHH5 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cxcl11Q9JHH5 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cxcl11Q9JHH5 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cxcl11Q9JHH5 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cxcl11Q9JHH5 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cxcl11Q9JHH5 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cxcl11Q9JHH5 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cxcl11Q9JHH5 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Cxcl11Q9JHH5 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cxcl11Q9JHH5 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cxcl11Q9JHH5 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cxcl11Q9JHH5 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cxcl11Q9JHH5 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cxcl11Q9JHH5 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cxcl11Q9JHH5 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cxcl11Q9JHH5 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cxcl11Q9JHH5 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cxcl11Q9JHH5 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cxcl11Q9JHH5 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cxcl11Q9JHH5 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cxcl11Q9JHH5 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Cxcl11Q9JHH5 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cxcl11Q9JHH5 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cxcl11Q9JHH5 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cxcl11Q9JHH5 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cxcl11Q9JHH5 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cxcl11Q9JHH5 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Cxcl11Q9JHH5 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cxcl11Q9JHH5 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cxcl11Q9JHH5 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cxcl11Q9JHH5 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cxcl11Q9JHH5 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cxcl11Q9JHH5 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cxcl11Q9JHH5 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Cxcl11Q9JHH5 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cxcl11Q9JHH5 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cxcl11Q9JHH5 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cxcl11Q9JHH5 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cxcl11Q9JHH5 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Cxcl11Q9JHH5 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cxcl11Q9JHH5 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cxcl11Q9JHH5 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cxcl11Q9JHH5 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66 ms