Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES63

Usp29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, mousemouse

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Length 869 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp29Q9ES63 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Usp29Q9ES63 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Usp29Q9ES63 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Usp29Q9ES63 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Usp29Q9ES63 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Usp29Q9ES63 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Usp29Q9ES63 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Usp29Q9ES63 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Usp29Q9ES63 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Usp29Q9ES63 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Usp29Q9ES63 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Usp29Q9ES63 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Usp29Q9ES63 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Usp29Q9ES63 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Usp29Q9ES63 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Usp29Q9ES63 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Usp29Q9ES63 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Usp29Q9ES63 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Usp29Q9ES63 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Usp29Q9ES63 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Usp29Q9ES63 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Usp29Q9ES63 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Usp29Q9ES63 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
Usp29Q9ES63 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Usp29Q9ES63 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Usp29Q9ES63 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Usp29Q9ES63 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Usp29Q9ES63 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Usp29Q9ES63 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Usp29Q9ES63 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Usp29Q9ES63 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Usp29Q9ES63 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Usp29Q9ES63 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Usp29Q9ES63 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Usp29Q9ES63 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Usp29Q9ES63 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Usp29Q9ES63 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Usp29Q9ES63 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Usp29Q9ES63 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Usp29Q9ES63 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Usp29Q9ES63 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Usp29Q9ES63 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Usp29Q9ES63 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Usp29Q9ES63 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Usp29Q9ES63 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Usp29Q9ES63 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Usp29Q9ES63 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Usp29Q9ES63 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Usp29Q9ES63 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Usp29Q9ES63 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Usp29Q9ES63 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Usp29Q9ES63 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Usp29Q9ES63 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Usp29Q9ES63 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Usp29Q9ES63 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Usp29Q9ES63 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Usp29Q9ES63 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Usp29Q9ES63 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Usp29Q9ES63 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Usp29Q9ES63 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Usp29Q9ES63 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Usp29Q9ES63 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Usp29Q9ES63 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Usp29Q9ES63 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Usp29Q9ES63 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Usp29Q9ES63 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Usp29Q9ES63 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Usp29Q9ES63 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Usp29Q9ES63 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Usp29Q9ES63 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Usp29Q9ES63 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Usp29Q9ES63 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Usp29Q9ES63 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Usp29Q9ES63 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Usp29Q9ES63 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Usp29Q9ES63 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Usp29Q9ES63 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Usp29Q9ES63 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Usp29Q9ES63 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Usp29Q9ES63 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Usp29Q9ES63 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Usp29Q9ES63 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Usp29Q9ES63 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Usp29Q9ES63 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Usp29Q9ES63 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Usp29Q9ES63 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Usp29Q9ES63 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Usp29Q9ES63 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Usp29Q9ES63 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Usp29Q9ES63 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Usp29Q9ES63 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Usp29Q9ES63 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
Usp29Q9ES63 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Usp29Q9ES63 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
Usp29Q9ES63 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Usp29Q9ES63 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Usp29Q9ES63 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Usp29Q9ES63 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Usp29Q9ES63 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Usp29Q9ES63 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
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