Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERK7

Chrnb2, Neuronal acetylcholine receptor subunit beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrnb2Q9ERK7 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Chrnb2Q9ERK7 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Chrnb2Q9ERK7 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Chrnb2Q9ERK7 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Chrnb2Q9ERK7 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Chrnb2Q9ERK7 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Chrnb2Q9ERK7 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Chrnb2Q9ERK7 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Chrnb2Q9ERK7 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Chrnb2Q9ERK7 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Chrnb2Q9ERK7 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Chrnb2Q9ERK7 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Chrnb2Q9ERK7 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Chrnb2Q9ERK7 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Chrnb2Q9ERK7 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Chrnb2Q9ERK7 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Chrnb2Q9ERK7 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Chrnb2Q9ERK7 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Chrnb2Q9ERK7 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Chrnb2Q9ERK7 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Chrnb2Q9ERK7 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Chrnb2Q9ERK7 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Chrnb2Q9ERK7 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Chrnb2Q9ERK7 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Chrnb2Q9ERK7 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Chrnb2Q9ERK7 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Chrnb2Q9ERK7 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Chrnb2Q9ERK7 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Chrnb2Q9ERK7 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Chrnb2Q9ERK7 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Chrnb2Q9ERK7 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Chrnb2Q9ERK7 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Chrnb2Q9ERK7 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Chrnb2Q9ERK7 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Chrnb2Q9ERK7 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Chrnb2Q9ERK7 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Chrnb2Q9ERK7 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Chrnb2Q9ERK7 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Chrnb2Q9ERK7 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Chrnb2Q9ERK7 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Chrnb2Q9ERK7 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Chrnb2Q9ERK7 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Chrnb2Q9ERK7 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Chrnb2Q9ERK7 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Chrnb2Q9ERK7 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Chrnb2Q9ERK7 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Chrnb2Q9ERK7 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Chrnb2Q9ERK7 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Chrnb2Q9ERK7 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Chrnb2Q9ERK7 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Chrnb2Q9ERK7 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Chrnb2Q9ERK7 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Chrnb2Q9ERK7 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Chrnb2Q9ERK7 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Chrnb2Q9ERK7 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Chrnb2Q9ERK7 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Chrnb2Q9ERK7 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Chrnb2Q9ERK7 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Chrnb2Q9ERK7 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Chrnb2Q9ERK7 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Chrnb2Q9ERK7 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Chrnb2Q9ERK7 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Chrnb2Q9ERK7 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Chrnb2Q9ERK7 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Chrnb2Q9ERK7 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Chrnb2Q9ERK7 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Chrnb2Q9ERK7 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Chrnb2Q9ERK7 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Chrnb2Q9ERK7 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Chrnb2Q9ERK7 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Chrnb2Q9ERK7 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Chrnb2Q9ERK7 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Chrnb2Q9ERK7 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Chrnb2Q9ERK7 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Chrnb2Q9ERK7 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Chrnb2Q9ERK7 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Chrnb2Q9ERK7 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Chrnb2Q9ERK7 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Chrnb2Q9ERK7 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Chrnb2Q9ERK7 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Chrnb2Q9ERK7 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Chrnb2Q9ERK7 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Chrnb2Q9ERK7 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Chrnb2Q9ERK7 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Chrnb2Q9ERK7 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Chrnb2Q9ERK7 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Chrnb2Q9ERK7 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Chrnb2Q9ERK7 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Chrnb2Q9ERK7 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Chrnb2Q9ERK7 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Chrnb2Q9ERK7 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Chrnb2Q9ERK7 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Chrnb2Q9ERK7 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Chrnb2Q9ERK7 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Chrnb2Q9ERK7 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Chrnb2Q9ERK7 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Chrnb2Q9ERK7 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Chrnb2Q9ERK7 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Chrnb2Q9ERK7 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Chrnb2Q9ERK7 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 135.7 ms