Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERK0

Ripk4, Receptor-interacting serine/threonine-protein kinase 4, mousemouse

Predictions only

Length 786 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ripk4Q9ERK0 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ripk4Q9ERK0 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Ripk4Q9ERK0 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ripk4Q9ERK0 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ripk4Q9ERK0 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ripk4Q9ERK0 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ripk4Q9ERK0 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ripk4Q9ERK0 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ripk4Q9ERK0 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Ripk4Q9ERK0 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ripk4Q9ERK0 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ripk4Q9ERK0 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ripk4Q9ERK0 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ripk4Q9ERK0 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Ripk4Q9ERK0 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ripk4Q9ERK0 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ripk4Q9ERK0 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ripk4Q9ERK0 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ripk4Q9ERK0 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ripk4Q9ERK0 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ripk4Q9ERK0 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ripk4Q9ERK0 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ripk4Q9ERK0 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ripk4Q9ERK0 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ripk4Q9ERK0 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ripk4Q9ERK0 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ripk4Q9ERK0 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ripk4Q9ERK0 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ripk4Q9ERK0 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ripk4Q9ERK0 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ripk4Q9ERK0 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ripk4Q9ERK0 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ripk4Q9ERK0 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ripk4Q9ERK0 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ripk4Q9ERK0 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ripk4Q9ERK0 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ripk4Q9ERK0 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ripk4Q9ERK0 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Ripk4Q9ERK0 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ripk4Q9ERK0 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ripk4Q9ERK0 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ripk4Q9ERK0 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Ripk4Q9ERK0 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ripk4Q9ERK0 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ripk4Q9ERK0 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ripk4Q9ERK0 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ripk4Q9ERK0 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ripk4Q9ERK0 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ripk4Q9ERK0 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ripk4Q9ERK0 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ripk4Q9ERK0 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ripk4Q9ERK0 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ripk4Q9ERK0 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ripk4Q9ERK0 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ripk4Q9ERK0 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ripk4Q9ERK0 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ripk4Q9ERK0 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ripk4Q9ERK0 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ripk4Q9ERK0 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ripk4Q9ERK0 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ripk4Q9ERK0 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ripk4Q9ERK0 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ripk4Q9ERK0 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ripk4Q9ERK0 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ripk4Q9ERK0 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ripk4Q9ERK0 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ripk4Q9ERK0 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ripk4Q9ERK0 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ripk4Q9ERK0 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Ripk4Q9ERK0 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Ripk4Q9ERK0 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ripk4Q9ERK0 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ripk4Q9ERK0 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ripk4Q9ERK0 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ripk4Q9ERK0 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ripk4Q9ERK0 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ripk4Q9ERK0 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ripk4Q9ERK0 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Ripk4Q9ERK0 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ripk4Q9ERK0 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ripk4Q9ERK0 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ripk4Q9ERK0 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ripk4Q9ERK0 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ripk4Q9ERK0 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ripk4Q9ERK0 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ripk4Q9ERK0 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ripk4Q9ERK0 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ripk4Q9ERK0 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ripk4Q9ERK0 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ripk4Q9ERK0 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ripk4Q9ERK0 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ripk4Q9ERK0 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ripk4Q9ERK0 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Ripk4Q9ERK0 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ripk4Q9ERK0 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ripk4Q9ERK0 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ripk4Q9ERK0 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ripk4Q9ERK0 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ripk4Q9ERK0 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ripk4Q9ERK0 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms