Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERG0

Lima1, LIM domain and actin-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lima1Q9ERG0 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lima1Q9ERG0 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lima1Q9ERG0 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lima1Q9ERG0 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lima1Q9ERG0 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lima1Q9ERG0 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lima1Q9ERG0 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lima1Q9ERG0 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lima1Q9ERG0 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lima1Q9ERG0 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lima1Q9ERG0 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lima1Q9ERG0 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lima1Q9ERG0 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Lima1Q9ERG0 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lima1Q9ERG0 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lima1Q9ERG0 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lima1Q9ERG0 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lima1Q9ERG0 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lima1Q9ERG0 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lima1Q9ERG0 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lima1Q9ERG0 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lima1Q9ERG0 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lima1Q9ERG0 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lima1Q9ERG0 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lima1Q9ERG0 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lima1Q9ERG0 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lima1Q9ERG0 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lima1Q9ERG0 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Lima1Q9ERG0 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lima1Q9ERG0 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lima1Q9ERG0 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Lima1Q9ERG0 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lima1Q9ERG0 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lima1Q9ERG0 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lima1Q9ERG0 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lima1Q9ERG0 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lima1Q9ERG0 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lima1Q9ERG0 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lima1Q9ERG0 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lima1Q9ERG0 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lima1Q9ERG0 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lima1Q9ERG0 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lima1Q9ERG0 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lima1Q9ERG0 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lima1Q9ERG0 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lima1Q9ERG0 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lima1Q9ERG0 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lima1Q9ERG0 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lima1Q9ERG0 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lima1Q9ERG0 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lima1Q9ERG0 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lima1Q9ERG0 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lima1Q9ERG0 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lima1Q9ERG0 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lima1Q9ERG0 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lima1Q9ERG0 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lima1Q9ERG0 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lima1Q9ERG0 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lima1Q9ERG0 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lima1Q9ERG0 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lima1Q9ERG0 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lima1Q9ERG0 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lima1Q9ERG0 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lima1Q9ERG0 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lima1Q9ERG0 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lima1Q9ERG0 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lima1Q9ERG0 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lima1Q9ERG0 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lima1Q9ERG0 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lima1Q9ERG0 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lima1Q9ERG0 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lima1Q9ERG0 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lima1Q9ERG0 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lima1Q9ERG0 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Lima1Q9ERG0 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lima1Q9ERG0 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lima1Q9ERG0 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lima1Q9ERG0 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lima1Q9ERG0 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lima1Q9ERG0 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lima1Q9ERG0 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lima1Q9ERG0 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lima1Q9ERG0 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lima1Q9ERG0 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lima1Q9ERG0 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lima1Q9ERG0 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lima1Q9ERG0 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lima1Q9ERG0 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lima1Q9ERG0 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lima1Q9ERG0 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lima1Q9ERG0 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lima1Q9ERG0 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Lima1Q9ERG0 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lima1Q9ERG0 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lima1Q9ERG0 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Lima1Q9ERG0 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Lima1Q9ERG0 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Lima1Q9ERG0 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Lima1Q9ERG0 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Lima1Q9ERG0 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms