Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER71

Rhoj, Rho-related GTP-binding protein RhoJ, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhojQ9ER71 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RhojQ9ER71 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RhojQ9ER71 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RhojQ9ER71 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RhojQ9ER71 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RhojQ9ER71 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RhojQ9ER71 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RhojQ9ER71 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RhojQ9ER71 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RhojQ9ER71 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RhojQ9ER71 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RhojQ9ER71 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RhojQ9ER71 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RhojQ9ER71 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RhojQ9ER71 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RhojQ9ER71 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RhojQ9ER71 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RhojQ9ER71 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RhojQ9ER71 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RhojQ9ER71 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
RhojQ9ER71 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RhojQ9ER71 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RhojQ9ER71 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RhojQ9ER71 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RhojQ9ER71 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RhojQ9ER71 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RhojQ9ER71 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RhojQ9ER71 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RhojQ9ER71 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RhojQ9ER71 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RhojQ9ER71 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RhojQ9ER71 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RhojQ9ER71 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RhojQ9ER71 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RhojQ9ER71 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RhojQ9ER71 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RhojQ9ER71 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RhojQ9ER71 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RhojQ9ER71 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RhojQ9ER71 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RhojQ9ER71 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RhojQ9ER71 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RhojQ9ER71 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RhojQ9ER71 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RhojQ9ER71 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RhojQ9ER71 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RhojQ9ER71 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
RhojQ9ER71 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RhojQ9ER71 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RhojQ9ER71 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RhojQ9ER71 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RhojQ9ER71 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RhojQ9ER71 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RhojQ9ER71 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
RhojQ9ER71 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RhojQ9ER71 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RhojQ9ER71 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RhojQ9ER71 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RhojQ9ER71 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
RhojQ9ER71 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RhojQ9ER71 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RhojQ9ER71 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RhojQ9ER71 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
RhojQ9ER71 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RhojQ9ER71 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RhojQ9ER71 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RhojQ9ER71 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RhojQ9ER71 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RhojQ9ER71 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RhojQ9ER71 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RhojQ9ER71 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RhojQ9ER71 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RhojQ9ER71 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RhojQ9ER71 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RhojQ9ER71 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RhojQ9ER71 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RhojQ9ER71 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RhojQ9ER71 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RhojQ9ER71 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RhojQ9ER71 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RhojQ9ER71 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
RhojQ9ER71 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RhojQ9ER71 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RhojQ9ER71 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
RhojQ9ER71 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
RhojQ9ER71 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RhojQ9ER71 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
RhojQ9ER71 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RhojQ9ER71 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RhojQ9ER71 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RhojQ9ER71 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RhojQ9ER71 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RhojQ9ER71 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RhojQ9ER71 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RhojQ9ER71 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RhojQ9ER71 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RhojQ9ER71 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RhojQ9ER71 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RhojQ9ER71 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RhojQ9ER71 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms