Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER65

Clstn2, Calsyntenin-2, mousemouse

Predictions only

Length 966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn2Q9ER65 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
Clstn2Q9ER65 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Clstn2Q9ER65 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Clstn2Q9ER65 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Clstn2Q9ER65 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
Clstn2Q9ER65 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Clstn2Q9ER65 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Clstn2Q9ER65 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Clstn2Q9ER65 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Clstn2Q9ER65 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Clstn2Q9ER65 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Clstn2Q9ER65 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Clstn2Q9ER65 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Clstn2Q9ER65 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Clstn2Q9ER65 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Clstn2Q9ER65 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Clstn2Q9ER65 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Clstn2Q9ER65 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
Clstn2Q9ER65 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Clstn2Q9ER65 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Clstn2Q9ER65 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Clstn2Q9ER65 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Clstn2Q9ER65 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
Clstn2Q9ER65 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Clstn2Q9ER65 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Clstn2Q9ER65 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Clstn2Q9ER65 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Clstn2Q9ER65 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Clstn2Q9ER65 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
Clstn2Q9ER65 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Clstn2Q9ER65 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Clstn2Q9ER65 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Clstn2Q9ER65 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Clstn2Q9ER65 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Clstn2Q9ER65 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Clstn2Q9ER65 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Clstn2Q9ER65 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Clstn2Q9ER65 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Clstn2Q9ER65 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Clstn2Q9ER65 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Clstn2Q9ER65 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Clstn2Q9ER65 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Clstn2Q9ER65 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
Clstn2Q9ER65 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
Clstn2Q9ER65 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Clstn2Q9ER65 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Clstn2Q9ER65 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Clstn2Q9ER65 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Clstn2Q9ER65 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Clstn2Q9ER65 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Clstn2Q9ER65 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Clstn2Q9ER65 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Clstn2Q9ER65 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Clstn2Q9ER65 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Clstn2Q9ER65 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Clstn2Q9ER65 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Clstn2Q9ER65 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Clstn2Q9ER65 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Clstn2Q9ER65 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Clstn2Q9ER65 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
Clstn2Q9ER65 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Clstn2Q9ER65 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Clstn2Q9ER65 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Clstn2Q9ER65 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Clstn2Q9ER65 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Clstn2Q9ER65 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Clstn2Q9ER65 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Clstn2Q9ER65 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Clstn2Q9ER65 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Clstn2Q9ER65 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Clstn2Q9ER65 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Clstn2Q9ER65 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Clstn2Q9ER65 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Clstn2Q9ER65 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Clstn2Q9ER65 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Clstn2Q9ER65 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Clstn2Q9ER65 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Clstn2Q9ER65 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Clstn2Q9ER65 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Clstn2Q9ER65 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Clstn2Q9ER65 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Clstn2Q9ER65 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Clstn2Q9ER65 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Clstn2Q9ER65 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Clstn2Q9ER65 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Clstn2Q9ER65 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Clstn2Q9ER65 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Clstn2Q9ER65 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Clstn2Q9ER65 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Clstn2Q9ER65 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
Clstn2Q9ER65 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
Clstn2Q9ER65 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Clstn2Q9ER65 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Clstn2Q9ER65 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Clstn2Q9ER65 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Clstn2Q9ER65 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Clstn2Q9ER65 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Clstn2Q9ER65 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Clstn2Q9ER65 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Clstn2Q9ER65 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms