Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQW4

Cyp3a44, Cytochrome P450, CYP3A, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp3a44Q9EQW4 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Cyp3a44Q9EQW4 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cyp3a44Q9EQW4 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cyp3a44Q9EQW4 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cyp3a44Q9EQW4 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cyp3a44Q9EQW4 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cyp3a44Q9EQW4 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cyp3a44Q9EQW4 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cyp3a44Q9EQW4 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cyp3a44Q9EQW4 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cyp3a44Q9EQW4 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cyp3a44Q9EQW4 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cyp3a44Q9EQW4 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cyp3a44Q9EQW4 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cyp3a44Q9EQW4 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cyp3a44Q9EQW4 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cyp3a44Q9EQW4 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cyp3a44Q9EQW4 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cyp3a44Q9EQW4 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cyp3a44Q9EQW4 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cyp3a44Q9EQW4 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cyp3a44Q9EQW4 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cyp3a44Q9EQW4 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cyp3a44Q9EQW4 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Cyp3a44Q9EQW4 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cyp3a44Q9EQW4 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cyp3a44Q9EQW4 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cyp3a44Q9EQW4 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cyp3a44Q9EQW4 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cyp3a44Q9EQW4 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cyp3a44Q9EQW4 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cyp3a44Q9EQW4 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cyp3a44Q9EQW4 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cyp3a44Q9EQW4 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cyp3a44Q9EQW4 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cyp3a44Q9EQW4 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cyp3a44Q9EQW4 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cyp3a44Q9EQW4 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cyp3a44Q9EQW4 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cyp3a44Q9EQW4 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cyp3a44Q9EQW4 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cyp3a44Q9EQW4 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cyp3a44Q9EQW4 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cyp3a44Q9EQW4 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cyp3a44Q9EQW4 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cyp3a44Q9EQW4 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cyp3a44Q9EQW4 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cyp3a44Q9EQW4 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Cyp3a44Q9EQW4 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Cyp3a44Q9EQW4 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cyp3a44Q9EQW4 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cyp3a44Q9EQW4 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cyp3a44Q9EQW4 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cyp3a44Q9EQW4 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cyp3a44Q9EQW4 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cyp3a44Q9EQW4 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cyp3a44Q9EQW4 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cyp3a44Q9EQW4 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cyp3a44Q9EQW4 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cyp3a44Q9EQW4 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cyp3a44Q9EQW4 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cyp3a44Q9EQW4 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cyp3a44Q9EQW4 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cyp3a44Q9EQW4 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cyp3a44Q9EQW4 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cyp3a44Q9EQW4 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cyp3a44Q9EQW4 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cyp3a44Q9EQW4 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cyp3a44Q9EQW4 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cyp3a44Q9EQW4 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cyp3a44Q9EQW4 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cyp3a44Q9EQW4 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cyp3a44Q9EQW4 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cyp3a44Q9EQW4 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Cyp3a44Q9EQW4 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cyp3a44Q9EQW4 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cyp3a44Q9EQW4 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cyp3a44Q9EQW4 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cyp3a44Q9EQW4 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cyp3a44Q9EQW4 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cyp3a44Q9EQW4 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cyp3a44Q9EQW4 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cyp3a44Q9EQW4 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cyp3a44Q9EQW4 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cyp3a44Q9EQW4 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cyp3a44Q9EQW4 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cyp3a44Q9EQW4 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cyp3a44Q9EQW4 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cyp3a44Q9EQW4 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cyp3a44Q9EQW4 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cyp3a44Q9EQW4 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cyp3a44Q9EQW4 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cyp3a44Q9EQW4 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cyp3a44Q9EQW4 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cyp3a44Q9EQW4 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cyp3a44Q9EQW4 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cyp3a44Q9EQW4 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cyp3a44Q9EQW4 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cyp3a44Q9EQW4 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cyp3a44Q9EQW4 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms