Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQR5

Lime1, Lck-interacting transmembrane adapter 1, mousemouse

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Length 269 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lime1Q9EQR5 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lime1Q9EQR5 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lime1Q9EQR5 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lime1Q9EQR5 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lime1Q9EQR5 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lime1Q9EQR5 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lime1Q9EQR5 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lime1Q9EQR5 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lime1Q9EQR5 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lime1Q9EQR5 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lime1Q9EQR5 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lime1Q9EQR5 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lime1Q9EQR5 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lime1Q9EQR5 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lime1Q9EQR5 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lime1Q9EQR5 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lime1Q9EQR5 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lime1Q9EQR5 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lime1Q9EQR5 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lime1Q9EQR5 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lime1Q9EQR5 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lime1Q9EQR5 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lime1Q9EQR5 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lime1Q9EQR5 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lime1Q9EQR5 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Lime1Q9EQR5 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lime1Q9EQR5 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lime1Q9EQR5 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lime1Q9EQR5 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lime1Q9EQR5 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lime1Q9EQR5 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lime1Q9EQR5 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lime1Q9EQR5 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lime1Q9EQR5 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lime1Q9EQR5 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lime1Q9EQR5 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Lime1Q9EQR5 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lime1Q9EQR5 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lime1Q9EQR5 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lime1Q9EQR5 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lime1Q9EQR5 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lime1Q9EQR5 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lime1Q9EQR5 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Lime1Q9EQR5 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lime1Q9EQR5 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lime1Q9EQR5 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lime1Q9EQR5 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lime1Q9EQR5 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lime1Q9EQR5 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lime1Q9EQR5 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lime1Q9EQR5 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lime1Q9EQR5 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lime1Q9EQR5 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lime1Q9EQR5 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lime1Q9EQR5 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lime1Q9EQR5 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lime1Q9EQR5 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lime1Q9EQR5 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lime1Q9EQR5 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lime1Q9EQR5 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Lime1Q9EQR5 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lime1Q9EQR5 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lime1Q9EQR5 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lime1Q9EQR5 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lime1Q9EQR5 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lime1Q9EQR5 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lime1Q9EQR5 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lime1Q9EQR5 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lime1Q9EQR5 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lime1Q9EQR5 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lime1Q9EQR5 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lime1Q9EQR5 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lime1Q9EQR5 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lime1Q9EQR5 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lime1Q9EQR5 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lime1Q9EQR5 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lime1Q9EQR5 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lime1Q9EQR5 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lime1Q9EQR5 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lime1Q9EQR5 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lime1Q9EQR5 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lime1Q9EQR5 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lime1Q9EQR5 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Lime1Q9EQR5 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lime1Q9EQR5 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lime1Q9EQR5 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lime1Q9EQR5 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lime1Q9EQR5 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lime1Q9EQR5 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lime1Q9EQR5 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lime1Q9EQR5 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lime1Q9EQR5 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lime1Q9EQR5 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lime1Q9EQR5 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lime1Q9EQR5 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lime1Q9EQR5 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lime1Q9EQR5 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lime1Q9EQR5 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lime1Q9EQR5 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lime1Q9EQR5 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms