Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ51

Vmn1r47, Vomeronasal type-1 receptor 47, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r47Q9EQ51 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r47Q9EQ51 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r47Q9EQ51 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r47Q9EQ51 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r47Q9EQ51 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r47Q9EQ51 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r47Q9EQ51 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r47Q9EQ51 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r47Q9EQ51 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r47Q9EQ51 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r47Q9EQ51 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r47Q9EQ51 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r47Q9EQ51 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r47Q9EQ51 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r47Q9EQ51 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r47Q9EQ51 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r47Q9EQ51 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r47Q9EQ51 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r47Q9EQ51 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r47Q9EQ51 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r47Q9EQ51 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r47Q9EQ51 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r47Q9EQ51 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r47Q9EQ51 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r47Q9EQ51 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r47Q9EQ51 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r47Q9EQ51 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r47Q9EQ51 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r47Q9EQ51 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r47Q9EQ51 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r47Q9EQ51 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r47Q9EQ51 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r47Q9EQ51 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r47Q9EQ51 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r47Q9EQ51 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r47Q9EQ51 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r47Q9EQ51 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r47Q9EQ51 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r47Q9EQ51 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r47Q9EQ51 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r47Q9EQ51 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r47Q9EQ51 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r47Q9EQ51 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r47Q9EQ51 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r47Q9EQ51 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r47Q9EQ51 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r47Q9EQ51 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r47Q9EQ51 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r47Q9EQ51 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r47Q9EQ51 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r47Q9EQ51 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r47Q9EQ51 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r47Q9EQ51 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r47Q9EQ51 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r47Q9EQ51 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r47Q9EQ51 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r47Q9EQ51 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r47Q9EQ51 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r47Q9EQ51 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r47Q9EQ51 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r47Q9EQ51 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r47Q9EQ51 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r47Q9EQ51 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r47Q9EQ51 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r47Q9EQ51 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r47Q9EQ51 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r47Q9EQ51 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r47Q9EQ51 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r47Q9EQ51 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r47Q9EQ51 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r47Q9EQ51 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r47Q9EQ51 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r47Q9EQ51 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r47Q9EQ51 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r47Q9EQ51 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r47Q9EQ51 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r47Q9EQ51 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r47Q9EQ51 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r47Q9EQ51 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r47Q9EQ51 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r47Q9EQ51 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r47Q9EQ51 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r47Q9EQ51 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r47Q9EQ51 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r47Q9EQ51 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r47Q9EQ51 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r47Q9EQ51 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r47Q9EQ51 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r47Q9EQ51 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r47Q9EQ51 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r47Q9EQ51 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r47Q9EQ51 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r47Q9EQ51 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r47Q9EQ51 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r47Q9EQ51 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r47Q9EQ51 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r47Q9EQ51 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r47Q9EQ51 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r47Q9EQ51 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r47Q9EQ51 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms