Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ08

Sgsh, Heparan N-sulfatase, mousemouse

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgshQ9EQ08 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SgshQ9EQ08 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SgshQ9EQ08 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SgshQ9EQ08 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SgshQ9EQ08 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SgshQ9EQ08 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SgshQ9EQ08 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SgshQ9EQ08 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
SgshQ9EQ08 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SgshQ9EQ08 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SgshQ9EQ08 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SgshQ9EQ08 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SgshQ9EQ08 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SgshQ9EQ08 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
SgshQ9EQ08 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SgshQ9EQ08 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SgshQ9EQ08 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SgshQ9EQ08 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SgshQ9EQ08 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SgshQ9EQ08 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
SgshQ9EQ08 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SgshQ9EQ08 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SgshQ9EQ08 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SgshQ9EQ08 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SgshQ9EQ08 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SgshQ9EQ08 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SgshQ9EQ08 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SgshQ9EQ08 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SgshQ9EQ08 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SgshQ9EQ08 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SgshQ9EQ08 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SgshQ9EQ08 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SgshQ9EQ08 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SgshQ9EQ08 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SgshQ9EQ08 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SgshQ9EQ08 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SgshQ9EQ08 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SgshQ9EQ08 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SgshQ9EQ08 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SgshQ9EQ08 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SgshQ9EQ08 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SgshQ9EQ08 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
SgshQ9EQ08 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
SgshQ9EQ08 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SgshQ9EQ08 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SgshQ9EQ08 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SgshQ9EQ08 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SgshQ9EQ08 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SgshQ9EQ08 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SgshQ9EQ08 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SgshQ9EQ08 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SgshQ9EQ08 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SgshQ9EQ08 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SgshQ9EQ08 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SgshQ9EQ08 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SgshQ9EQ08 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SgshQ9EQ08 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SgshQ9EQ08 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SgshQ9EQ08 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SgshQ9EQ08 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SgshQ9EQ08 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SgshQ9EQ08 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SgshQ9EQ08 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SgshQ9EQ08 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SgshQ9EQ08 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SgshQ9EQ08 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SgshQ9EQ08 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SgshQ9EQ08 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SgshQ9EQ08 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SgshQ9EQ08 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
SgshQ9EQ08 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SgshQ9EQ08 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SgshQ9EQ08 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SgshQ9EQ08 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SgshQ9EQ08 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SgshQ9EQ08 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SgshQ9EQ08 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SgshQ9EQ08 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SgshQ9EQ08 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SgshQ9EQ08 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SgshQ9EQ08 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SgshQ9EQ08 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SgshQ9EQ08 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SgshQ9EQ08 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SgshQ9EQ08 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
SgshQ9EQ08 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SgshQ9EQ08 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
SgshQ9EQ08 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SgshQ9EQ08 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SgshQ9EQ08 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SgshQ9EQ08 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SgshQ9EQ08 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SgshQ9EQ08 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SgshQ9EQ08 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SgshQ9EQ08 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SgshQ9EQ08 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SgshQ9EQ08 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
SgshQ9EQ08 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SgshQ9EQ08 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SgshQ9EQ08 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.3 ms