Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCU6

Mrpl4, 39S ribosomal protein L4, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 294 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl4Q9DCU6 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Mrpl4Q9DCU6 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Mrpl4Q9DCU6 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Mrpl4Q9DCU6 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Mrpl4Q9DCU6 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Mrpl4Q9DCU6 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Mrpl4Q9DCU6 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Mrpl4Q9DCU6 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Mrpl4Q9DCU6 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Mrpl4Q9DCU6 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Mrpl4Q9DCU6 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Mrpl4Q9DCU6 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Mrpl4Q9DCU6 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Mrpl4Q9DCU6 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Mrpl4Q9DCU6 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Mrpl4Q9DCU6 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Mrpl4Q9DCU6 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Mrpl4Q9DCU6 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Mrpl4Q9DCU6 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Mrpl4Q9DCU6 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Mrpl4Q9DCU6 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Mrpl4Q9DCU6 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Mrpl4Q9DCU6 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Mrpl4Q9DCU6 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Mrpl4Q9DCU6 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Mrpl4Q9DCU6 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Mrpl4Q9DCU6 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Mrpl4Q9DCU6 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Mrpl4Q9DCU6 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Mrpl4Q9DCU6 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Mrpl4Q9DCU6 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Mrpl4Q9DCU6 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Mrpl4Q9DCU6 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Mrpl4Q9DCU6 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Mrpl4Q9DCU6 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Mrpl4Q9DCU6 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Mrpl4Q9DCU6 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Mrpl4Q9DCU6 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Mrpl4Q9DCU6 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Mrpl4Q9DCU6 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Mrpl4Q9DCU6 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Mrpl4Q9DCU6 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Mrpl4Q9DCU6 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Mrpl4Q9DCU6 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Mrpl4Q9DCU6 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Mrpl4Q9DCU6 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Mrpl4Q9DCU6 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Mrpl4Q9DCU6 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Mrpl4Q9DCU6 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Mrpl4Q9DCU6 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Mrpl4Q9DCU6 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Mrpl4Q9DCU6 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Mrpl4Q9DCU6 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Mrpl4Q9DCU6 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Mrpl4Q9DCU6 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Mrpl4Q9DCU6 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Mrpl4Q9DCU6 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Mrpl4Q9DCU6 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Mrpl4Q9DCU6 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Mrpl4Q9DCU6 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Mrpl4Q9DCU6 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Mrpl4Q9DCU6 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Mrpl4Q9DCU6 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Mrpl4Q9DCU6 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Mrpl4Q9DCU6 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Mrpl4Q9DCU6 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Mrpl4Q9DCU6 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Mrpl4Q9DCU6 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Mrpl4Q9DCU6 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Mrpl4Q9DCU6 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Mrpl4Q9DCU6 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Mrpl4Q9DCU6 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Mrpl4Q9DCU6 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Mrpl4Q9DCU6 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Mrpl4Q9DCU6 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Mrpl4Q9DCU6 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Mrpl4Q9DCU6 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Mrpl4Q9DCU6 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Mrpl4Q9DCU6 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Mrpl4Q9DCU6 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Mrpl4Q9DCU6 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Mrpl4Q9DCU6 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Mrpl4Q9DCU6 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Mrpl4Q9DCU6 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Mrpl4Q9DCU6 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Mrpl4Q9DCU6 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Mrpl4Q9DCU6 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Mrpl4Q9DCU6 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Mrpl4Q9DCU6 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Mrpl4Q9DCU6 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Mrpl4Q9DCU6 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Mrpl4Q9DCU6 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Mrpl4Q9DCU6 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Mrpl4Q9DCU6 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Mrpl4Q9DCU6 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Mrpl4Q9DCU6 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Mrpl4Q9DCU6 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Mrpl4Q9DCU6 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Mrpl4Q9DCU6 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Mrpl4Q9DCU6 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 164 ms