Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCK3

Tspan4, Tetraspanin-4, mousemouse

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan4Q9DCK3 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tspan4Q9DCK3 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tspan4Q9DCK3 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tspan4Q9DCK3 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tspan4Q9DCK3 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Tspan4Q9DCK3 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tspan4Q9DCK3 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tspan4Q9DCK3 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tspan4Q9DCK3 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tspan4Q9DCK3 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tspan4Q9DCK3 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tspan4Q9DCK3 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tspan4Q9DCK3 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tspan4Q9DCK3 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tspan4Q9DCK3 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tspan4Q9DCK3 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tspan4Q9DCK3 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tspan4Q9DCK3 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tspan4Q9DCK3 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tspan4Q9DCK3 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tspan4Q9DCK3 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tspan4Q9DCK3 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tspan4Q9DCK3 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tspan4Q9DCK3 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tspan4Q9DCK3 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tspan4Q9DCK3 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tspan4Q9DCK3 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tspan4Q9DCK3 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tspan4Q9DCK3 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tspan4Q9DCK3 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tspan4Q9DCK3 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tspan4Q9DCK3 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tspan4Q9DCK3 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tspan4Q9DCK3 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tspan4Q9DCK3 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tspan4Q9DCK3 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Tspan4Q9DCK3 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tspan4Q9DCK3 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tspan4Q9DCK3 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tspan4Q9DCK3 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tspan4Q9DCK3 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tspan4Q9DCK3 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Tspan4Q9DCK3 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Tspan4Q9DCK3 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tspan4Q9DCK3 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tspan4Q9DCK3 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tspan4Q9DCK3 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tspan4Q9DCK3 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tspan4Q9DCK3 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tspan4Q9DCK3 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tspan4Q9DCK3 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tspan4Q9DCK3 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tspan4Q9DCK3 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tspan4Q9DCK3 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tspan4Q9DCK3 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tspan4Q9DCK3 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tspan4Q9DCK3 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tspan4Q9DCK3 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tspan4Q9DCK3 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tspan4Q9DCK3 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tspan4Q9DCK3 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tspan4Q9DCK3 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tspan4Q9DCK3 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tspan4Q9DCK3 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tspan4Q9DCK3 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tspan4Q9DCK3 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tspan4Q9DCK3 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tspan4Q9DCK3 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tspan4Q9DCK3 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tspan4Q9DCK3 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tspan4Q9DCK3 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tspan4Q9DCK3 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tspan4Q9DCK3 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tspan4Q9DCK3 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tspan4Q9DCK3 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tspan4Q9DCK3 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tspan4Q9DCK3 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tspan4Q9DCK3 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tspan4Q9DCK3 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tspan4Q9DCK3 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tspan4Q9DCK3 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tspan4Q9DCK3 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tspan4Q9DCK3 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tspan4Q9DCK3 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tspan4Q9DCK3 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tspan4Q9DCK3 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tspan4Q9DCK3 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tspan4Q9DCK3 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tspan4Q9DCK3 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tspan4Q9DCK3 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tspan4Q9DCK3 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tspan4Q9DCK3 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tspan4Q9DCK3 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tspan4Q9DCK3 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tspan4Q9DCK3 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tspan4Q9DCK3 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Tspan4Q9DCK3 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tspan4Q9DCK3 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tspan4Q9DCK3 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tspan4Q9DCK3 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms