Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCG9

Trmt112, Multifunctional methyltransferase subunit TRM112-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trmt112Q9DCG9 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trmt112Q9DCG9 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trmt112Q9DCG9 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trmt112Q9DCG9 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trmt112Q9DCG9 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trmt112Q9DCG9 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trmt112Q9DCG9 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trmt112Q9DCG9 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trmt112Q9DCG9 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trmt112Q9DCG9 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trmt112Q9DCG9 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trmt112Q9DCG9 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trmt112Q9DCG9 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Trmt112Q9DCG9 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trmt112Q9DCG9 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trmt112Q9DCG9 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Trmt112Q9DCG9 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trmt112Q9DCG9 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Trmt112Q9DCG9 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Trmt112Q9DCG9 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Trmt112Q9DCG9 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Trmt112Q9DCG9 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Trmt112Q9DCG9 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Trmt112Q9DCG9 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Trmt112Q9DCG9 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Trmt112Q9DCG9 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Trmt112Q9DCG9 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Trmt112Q9DCG9 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Trmt112Q9DCG9 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Trmt112Q9DCG9 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Trmt112Q9DCG9 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Trmt112Q9DCG9 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Trmt112Q9DCG9 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Trmt112Q9DCG9 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Trmt112Q9DCG9 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Trmt112Q9DCG9 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Trmt112Q9DCG9 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Trmt112Q9DCG9 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Trmt112Q9DCG9 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Trmt112Q9DCG9 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Trmt112Q9DCG9 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Trmt112Q9DCG9 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Trmt112Q9DCG9 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Trmt112Q9DCG9 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Trmt112Q9DCG9 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Trmt112Q9DCG9 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Trmt112Q9DCG9 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Trmt112Q9DCG9 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Trmt112Q9DCG9 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Trmt112Q9DCG9 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Trmt112Q9DCG9 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Trmt112Q9DCG9 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Trmt112Q9DCG9 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Trmt112Q9DCG9 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Trmt112Q9DCG9 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Trmt112Q9DCG9 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Trmt112Q9DCG9 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Trmt112Q9DCG9 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Trmt112Q9DCG9 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Trmt112Q9DCG9 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Trmt112Q9DCG9 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Trmt112Q9DCG9 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Trmt112Q9DCG9 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Trmt112Q9DCG9 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Trmt112Q9DCG9 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Trmt112Q9DCG9 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Trmt112Q9DCG9 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Trmt112Q9DCG9 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Trmt112Q9DCG9 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Trmt112Q9DCG9 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Trmt112Q9DCG9 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Trmt112Q9DCG9 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Trmt112Q9DCG9 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Trmt112Q9DCG9 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Trmt112Q9DCG9 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Trmt112Q9DCG9 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Trmt112Q9DCG9 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Trmt112Q9DCG9 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Trmt112Q9DCG9 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Trmt112Q9DCG9 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Trmt112Q9DCG9 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Trmt112Q9DCG9 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Trmt112Q9DCG9 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Trmt112Q9DCG9 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Trmt112Q9DCG9 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Trmt112Q9DCG9 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Trmt112Q9DCG9 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Trmt112Q9DCG9 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Trmt112Q9DCG9 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Trmt112Q9DCG9 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Trmt112Q9DCG9 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Trmt112Q9DCG9 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Trmt112Q9DCG9 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Trmt112Q9DCG9 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Trmt112Q9DCG9 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Trmt112Q9DCG9 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Trmt112Q9DCG9 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Trmt112Q9DCG9 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Trmt112Q9DCG9 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Trmt112Q9DCG9 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms