Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCE5

Pak1ip1, p21-activated protein kinase-interacting protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 382 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pak1ip1Q9DCE5 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pak1ip1Q9DCE5 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pak1ip1Q9DCE5 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pak1ip1Q9DCE5 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pak1ip1Q9DCE5 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pak1ip1Q9DCE5 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Pak1ip1Q9DCE5 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Pak1ip1Q9DCE5 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Pak1ip1Q9DCE5 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Pak1ip1Q9DCE5 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pak1ip1Q9DCE5 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pak1ip1Q9DCE5 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Pak1ip1Q9DCE5 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Pak1ip1Q9DCE5 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Pak1ip1Q9DCE5 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Pak1ip1Q9DCE5 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Pak1ip1Q9DCE5 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Pak1ip1Q9DCE5 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Pak1ip1Q9DCE5 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Pak1ip1Q9DCE5 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Pak1ip1Q9DCE5 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Pak1ip1Q9DCE5 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Pak1ip1Q9DCE5 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Pak1ip1Q9DCE5 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Pak1ip1Q9DCE5 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Pak1ip1Q9DCE5 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Pak1ip1Q9DCE5 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC19.02■□□□□ 0.63
Pak1ip1Q9DCE5 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pak1ip1Q9DCE5 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pak1ip1Q9DCE5 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pak1ip1Q9DCE5 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Pak1ip1Q9DCE5 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pak1ip1Q9DCE5 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pak1ip1Q9DCE5 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pak1ip1Q9DCE5 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pak1ip1Q9DCE5 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pak1ip1Q9DCE5 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pak1ip1Q9DCE5 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pak1ip1Q9DCE5 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pak1ip1Q9DCE5 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pak1ip1Q9DCE5 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pak1ip1Q9DCE5 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pak1ip1Q9DCE5 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Pak1ip1Q9DCE5 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pak1ip1Q9DCE5 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pak1ip1Q9DCE5 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Pak1ip1Q9DCE5 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pak1ip1Q9DCE5 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pak1ip1Q9DCE5 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Pak1ip1Q9DCE5 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Pak1ip1Q9DCE5 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Pak1ip1Q9DCE5 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pak1ip1Q9DCE5 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pak1ip1Q9DCE5 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Pak1ip1Q9DCE5 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Pak1ip1Q9DCE5 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pak1ip1Q9DCE5 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pak1ip1Q9DCE5 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pak1ip1Q9DCE5 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pak1ip1Q9DCE5 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pak1ip1Q9DCE5 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pak1ip1Q9DCE5 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pak1ip1Q9DCE5 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pak1ip1Q9DCE5 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Pak1ip1Q9DCE5 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pak1ip1Q9DCE5 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pak1ip1Q9DCE5 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pak1ip1Q9DCE5 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pak1ip1Q9DCE5 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pak1ip1Q9DCE5 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pak1ip1Q9DCE5 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pak1ip1Q9DCE5 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pak1ip1Q9DCE5 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pak1ip1Q9DCE5 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pak1ip1Q9DCE5 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pak1ip1Q9DCE5 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Pak1ip1Q9DCE5 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pak1ip1Q9DCE5 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pak1ip1Q9DCE5 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pak1ip1Q9DCE5 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pak1ip1Q9DCE5 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pak1ip1Q9DCE5 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pak1ip1Q9DCE5 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pak1ip1Q9DCE5 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pak1ip1Q9DCE5 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Pak1ip1Q9DCE5 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pak1ip1Q9DCE5 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pak1ip1Q9DCE5 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pak1ip1Q9DCE5 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pak1ip1Q9DCE5 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pak1ip1Q9DCE5 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pak1ip1Q9DCE5 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pak1ip1Q9DCE5 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pak1ip1Q9DCE5 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pak1ip1Q9DCE5 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pak1ip1Q9DCE5 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pak1ip1Q9DCE5 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pak1ip1Q9DCE5 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pak1ip1Q9DCE5 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pak1ip1Q9DCE5 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms