Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCD2

Xab2, Pre-mRNA-splicing factor SYF1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xab2Q9DCD2 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Xab2Q9DCD2 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Xab2Q9DCD2 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Xab2Q9DCD2 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Xab2Q9DCD2 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Xab2Q9DCD2 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Xab2Q9DCD2 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Xab2Q9DCD2 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Xab2Q9DCD2 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Xab2Q9DCD2 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Xab2Q9DCD2 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Xab2Q9DCD2 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Xab2Q9DCD2 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Xab2Q9DCD2 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Xab2Q9DCD2 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Xab2Q9DCD2 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Xab2Q9DCD2 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Xab2Q9DCD2 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Xab2Q9DCD2 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Xab2Q9DCD2 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Xab2Q9DCD2 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Xab2Q9DCD2 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Xab2Q9DCD2 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Xab2Q9DCD2 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Xab2Q9DCD2 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Xab2Q9DCD2 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Xab2Q9DCD2 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Xab2Q9DCD2 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Xab2Q9DCD2 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Xab2Q9DCD2 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Xab2Q9DCD2 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Xab2Q9DCD2 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Xab2Q9DCD2 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Xab2Q9DCD2 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Xab2Q9DCD2 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Xab2Q9DCD2 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Xab2Q9DCD2 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Xab2Q9DCD2 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Xab2Q9DCD2 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Xab2Q9DCD2 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Xab2Q9DCD2 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Xab2Q9DCD2 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Xab2Q9DCD2 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Xab2Q9DCD2 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Xab2Q9DCD2 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Xab2Q9DCD2 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Xab2Q9DCD2 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Xab2Q9DCD2 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Xab2Q9DCD2 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Xab2Q9DCD2 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Xab2Q9DCD2 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Xab2Q9DCD2 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Xab2Q9DCD2 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Xab2Q9DCD2 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Xab2Q9DCD2 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Xab2Q9DCD2 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Xab2Q9DCD2 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Xab2Q9DCD2 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Xab2Q9DCD2 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Xab2Q9DCD2 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Xab2Q9DCD2 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Xab2Q9DCD2 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Xab2Q9DCD2 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Xab2Q9DCD2 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Xab2Q9DCD2 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Xab2Q9DCD2 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Xab2Q9DCD2 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Xab2Q9DCD2 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Xab2Q9DCD2 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Xab2Q9DCD2 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Xab2Q9DCD2 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Xab2Q9DCD2 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Xab2Q9DCD2 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Xab2Q9DCD2 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Xab2Q9DCD2 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Xab2Q9DCD2 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Xab2Q9DCD2 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Xab2Q9DCD2 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Xab2Q9DCD2 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Xab2Q9DCD2 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Xab2Q9DCD2 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Xab2Q9DCD2 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Xab2Q9DCD2 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Xab2Q9DCD2 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Xab2Q9DCD2 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Xab2Q9DCD2 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Xab2Q9DCD2 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Xab2Q9DCD2 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Xab2Q9DCD2 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Xab2Q9DCD2 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Xab2Q9DCD2 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Xab2Q9DCD2 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Xab2Q9DCD2 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Xab2Q9DCD2 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Xab2Q9DCD2 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Xab2Q9DCD2 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Xab2Q9DCD2 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Xab2Q9DCD2 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Xab2Q9DCD2 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Xab2Q9DCD2 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms