Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBY5

Cbx6, Chromobox protein homolog 6, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx6Q9DBY5 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cbx6Q9DBY5 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cbx6Q9DBY5 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cbx6Q9DBY5 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cbx6Q9DBY5 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Cbx6Q9DBY5 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cbx6Q9DBY5 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cbx6Q9DBY5 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cbx6Q9DBY5 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cbx6Q9DBY5 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cbx6Q9DBY5 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cbx6Q9DBY5 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Cbx6Q9DBY5 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cbx6Q9DBY5 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cbx6Q9DBY5 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cbx6Q9DBY5 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cbx6Q9DBY5 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cbx6Q9DBY5 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cbx6Q9DBY5 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cbx6Q9DBY5 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cbx6Q9DBY5 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cbx6Q9DBY5 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cbx6Q9DBY5 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cbx6Q9DBY5 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cbx6Q9DBY5 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cbx6Q9DBY5 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cbx6Q9DBY5 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cbx6Q9DBY5 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cbx6Q9DBY5 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cbx6Q9DBY5 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cbx6Q9DBY5 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cbx6Q9DBY5 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cbx6Q9DBY5 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cbx6Q9DBY5 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cbx6Q9DBY5 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cbx6Q9DBY5 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cbx6Q9DBY5 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cbx6Q9DBY5 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cbx6Q9DBY5 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cbx6Q9DBY5 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cbx6Q9DBY5 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cbx6Q9DBY5 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cbx6Q9DBY5 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cbx6Q9DBY5 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cbx6Q9DBY5 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cbx6Q9DBY5 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cbx6Q9DBY5 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cbx6Q9DBY5 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cbx6Q9DBY5 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cbx6Q9DBY5 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cbx6Q9DBY5 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cbx6Q9DBY5 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cbx6Q9DBY5 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cbx6Q9DBY5 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Cbx6Q9DBY5 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cbx6Q9DBY5 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Cbx6Q9DBY5 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cbx6Q9DBY5 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cbx6Q9DBY5 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cbx6Q9DBY5 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cbx6Q9DBY5 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cbx6Q9DBY5 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cbx6Q9DBY5 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cbx6Q9DBY5 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cbx6Q9DBY5 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cbx6Q9DBY5 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cbx6Q9DBY5 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cbx6Q9DBY5 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cbx6Q9DBY5 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cbx6Q9DBY5 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cbx6Q9DBY5 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cbx6Q9DBY5 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cbx6Q9DBY5 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cbx6Q9DBY5 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cbx6Q9DBY5 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cbx6Q9DBY5 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cbx6Q9DBY5 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Cbx6Q9DBY5 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cbx6Q9DBY5 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cbx6Q9DBY5 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Cbx6Q9DBY5 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cbx6Q9DBY5 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cbx6Q9DBY5 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cbx6Q9DBY5 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cbx6Q9DBY5 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cbx6Q9DBY5 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cbx6Q9DBY5 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cbx6Q9DBY5 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Cbx6Q9DBY5 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Cbx6Q9DBY5 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cbx6Q9DBY5 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cbx6Q9DBY5 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cbx6Q9DBY5 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cbx6Q9DBY5 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cbx6Q9DBY5 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cbx6Q9DBY5 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cbx6Q9DBY5 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cbx6Q9DBY5 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cbx6Q9DBY5 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cbx6Q9DBY5 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms