Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBY0

Foxp4, Forkhead box protein P4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 795 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxp4Q9DBY0 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Foxp4Q9DBY0 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Foxp4Q9DBY0 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Foxp4Q9DBY0 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Foxp4Q9DBY0 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Foxp4Q9DBY0 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Foxp4Q9DBY0 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Foxp4Q9DBY0 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Foxp4Q9DBY0 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Foxp4Q9DBY0 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Foxp4Q9DBY0 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Foxp4Q9DBY0 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Foxp4Q9DBY0 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Foxp4Q9DBY0 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Foxp4Q9DBY0 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Foxp4Q9DBY0 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Foxp4Q9DBY0 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Foxp4Q9DBY0 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Foxp4Q9DBY0 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Foxp4Q9DBY0 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Foxp4Q9DBY0 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Foxp4Q9DBY0 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Foxp4Q9DBY0 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Foxp4Q9DBY0 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Foxp4Q9DBY0 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Foxp4Q9DBY0 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Foxp4Q9DBY0 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Foxp4Q9DBY0 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Foxp4Q9DBY0 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Foxp4Q9DBY0 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Foxp4Q9DBY0 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Foxp4Q9DBY0 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Foxp4Q9DBY0 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Foxp4Q9DBY0 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Foxp4Q9DBY0 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Foxp4Q9DBY0 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Foxp4Q9DBY0 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Foxp4Q9DBY0 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Foxp4Q9DBY0 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Foxp4Q9DBY0 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Foxp4Q9DBY0 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Foxp4Q9DBY0 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Foxp4Q9DBY0 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Foxp4Q9DBY0 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Foxp4Q9DBY0 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Foxp4Q9DBY0 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Foxp4Q9DBY0 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Foxp4Q9DBY0 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Foxp4Q9DBY0 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Foxp4Q9DBY0 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Foxp4Q9DBY0 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Foxp4Q9DBY0 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Foxp4Q9DBY0 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Foxp4Q9DBY0 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Foxp4Q9DBY0 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Foxp4Q9DBY0 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Foxp4Q9DBY0 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Foxp4Q9DBY0 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Foxp4Q9DBY0 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Foxp4Q9DBY0 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Foxp4Q9DBY0 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Foxp4Q9DBY0 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Foxp4Q9DBY0 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Foxp4Q9DBY0 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Foxp4Q9DBY0 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Foxp4Q9DBY0 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Foxp4Q9DBY0 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Foxp4Q9DBY0 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Foxp4Q9DBY0 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Foxp4Q9DBY0 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Foxp4Q9DBY0 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Foxp4Q9DBY0 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Foxp4Q9DBY0 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Foxp4Q9DBY0 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Foxp4Q9DBY0 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Foxp4Q9DBY0 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Foxp4Q9DBY0 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Foxp4Q9DBY0 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Foxp4Q9DBY0 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Foxp4Q9DBY0 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Foxp4Q9DBY0 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Foxp4Q9DBY0 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Foxp4Q9DBY0 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Foxp4Q9DBY0 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Foxp4Q9DBY0 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Foxp4Q9DBY0 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Foxp4Q9DBY0 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Foxp4Q9DBY0 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Foxp4Q9DBY0 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Foxp4Q9DBY0 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Foxp4Q9DBY0 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Foxp4Q9DBY0 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Foxp4Q9DBY0 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Foxp4Q9DBY0 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Foxp4Q9DBY0 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Foxp4Q9DBY0 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Foxp4Q9DBY0 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Foxp4Q9DBY0 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Foxp4Q9DBY0 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Foxp4Q9DBY0 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms