Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB91

Med29, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 29, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med29Q9DB91 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Med29Q9DB91 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Med29Q9DB91 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Med29Q9DB91 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Med29Q9DB91 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Med29Q9DB91 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Med29Q9DB91 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Med29Q9DB91 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Med29Q9DB91 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Med29Q9DB91 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Med29Q9DB91 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Med29Q9DB91 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Med29Q9DB91 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Med29Q9DB91 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Med29Q9DB91 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Med29Q9DB91 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Med29Q9DB91 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Med29Q9DB91 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Med29Q9DB91 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Med29Q9DB91 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Med29Q9DB91 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Med29Q9DB91 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Med29Q9DB91 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Med29Q9DB91 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Med29Q9DB91 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Med29Q9DB91 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Med29Q9DB91 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Med29Q9DB91 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Med29Q9DB91 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Med29Q9DB91 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Med29Q9DB91 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Med29Q9DB91 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Med29Q9DB91 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Med29Q9DB91 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Med29Q9DB91 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Med29Q9DB91 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Med29Q9DB91 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Med29Q9DB91 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Med29Q9DB91 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Med29Q9DB91 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Med29Q9DB91 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Med29Q9DB91 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Med29Q9DB91 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Med29Q9DB91 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Med29Q9DB91 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Med29Q9DB91 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Med29Q9DB91 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Med29Q9DB91 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Med29Q9DB91 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Med29Q9DB91 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Med29Q9DB91 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Med29Q9DB91 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Med29Q9DB91 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Med29Q9DB91 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Med29Q9DB91 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Med29Q9DB91 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Med29Q9DB91 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Med29Q9DB91 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Med29Q9DB91 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Med29Q9DB91 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Med29Q9DB91 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Med29Q9DB91 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Med29Q9DB91 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Med29Q9DB91 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Med29Q9DB91 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Med29Q9DB91 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Med29Q9DB91 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Med29Q9DB91 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Med29Q9DB91 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Med29Q9DB91 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Med29Q9DB91 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Med29Q9DB91 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Med29Q9DB91 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Med29Q9DB91 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Med29Q9DB91 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Med29Q9DB91 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Med29Q9DB91 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Med29Q9DB91 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Med29Q9DB91 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Med29Q9DB91 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Med29Q9DB91 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Med29Q9DB91 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Med29Q9DB91 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Med29Q9DB91 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Med29Q9DB91 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Med29Q9DB91 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Med29Q9DB91 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Med29Q9DB91 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Med29Q9DB91 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Med29Q9DB91 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Med29Q9DB91 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Med29Q9DB91 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Med29Q9DB91 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Med29Q9DB91 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Med29Q9DB91 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Med29Q9DB91 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Med29Q9DB91 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Med29Q9DB91 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Med29Q9DB91 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Med29Q9DB91 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80 ms