Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAW6

Prpf4, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf4Q9DAW6 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Prpf4Q9DAW6 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Prpf4Q9DAW6 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Prpf4Q9DAW6 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Prpf4Q9DAW6 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Prpf4Q9DAW6 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Prpf4Q9DAW6 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Prpf4Q9DAW6 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Prpf4Q9DAW6 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Prpf4Q9DAW6 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Prpf4Q9DAW6 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Prpf4Q9DAW6 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Prpf4Q9DAW6 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Prpf4Q9DAW6 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Prpf4Q9DAW6 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Prpf4Q9DAW6 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Prpf4Q9DAW6 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Prpf4Q9DAW6 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Prpf4Q9DAW6 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Prpf4Q9DAW6 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Prpf4Q9DAW6 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Prpf4Q9DAW6 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Prpf4Q9DAW6 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Prpf4Q9DAW6 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Prpf4Q9DAW6 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Prpf4Q9DAW6 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Prpf4Q9DAW6 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Prpf4Q9DAW6 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Prpf4Q9DAW6 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Prpf4Q9DAW6 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Prpf4Q9DAW6 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Prpf4Q9DAW6 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Prpf4Q9DAW6 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Prpf4Q9DAW6 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Prpf4Q9DAW6 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Prpf4Q9DAW6 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Prpf4Q9DAW6 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Prpf4Q9DAW6 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Prpf4Q9DAW6 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Prpf4Q9DAW6 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Prpf4Q9DAW6 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Prpf4Q9DAW6 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Prpf4Q9DAW6 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Prpf4Q9DAW6 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Prpf4Q9DAW6 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Prpf4Q9DAW6 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Prpf4Q9DAW6 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Prpf4Q9DAW6 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Prpf4Q9DAW6 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Prpf4Q9DAW6 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Prpf4Q9DAW6 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Prpf4Q9DAW6 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Prpf4Q9DAW6 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Prpf4Q9DAW6 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Prpf4Q9DAW6 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Prpf4Q9DAW6 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Prpf4Q9DAW6 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Prpf4Q9DAW6 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Prpf4Q9DAW6 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Prpf4Q9DAW6 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Prpf4Q9DAW6 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Prpf4Q9DAW6 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Prpf4Q9DAW6 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Prpf4Q9DAW6 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Prpf4Q9DAW6 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Prpf4Q9DAW6 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Prpf4Q9DAW6 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Prpf4Q9DAW6 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Prpf4Q9DAW6 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Prpf4Q9DAW6 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Prpf4Q9DAW6 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Prpf4Q9DAW6 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Prpf4Q9DAW6 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Prpf4Q9DAW6 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Prpf4Q9DAW6 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Prpf4Q9DAW6 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Prpf4Q9DAW6 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Prpf4Q9DAW6 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Prpf4Q9DAW6 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Prpf4Q9DAW6 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Prpf4Q9DAW6 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Prpf4Q9DAW6 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Prpf4Q9DAW6 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Prpf4Q9DAW6 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Prpf4Q9DAW6 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Prpf4Q9DAW6 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Prpf4Q9DAW6 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Prpf4Q9DAW6 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Prpf4Q9DAW6 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Prpf4Q9DAW6 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Prpf4Q9DAW6 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Prpf4Q9DAW6 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Prpf4Q9DAW6 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Prpf4Q9DAW6 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Prpf4Q9DAW6 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Prpf4Q9DAW6 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Prpf4Q9DAW6 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Prpf4Q9DAW6 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Prpf4Q9DAW6 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Prpf4Q9DAW6 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms