Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAU1

Cnpy3, Protein canopy homolog 3, mousemouse

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Length 276 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnpy3Q9DAU1 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cnpy3Q9DAU1 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cnpy3Q9DAU1 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cnpy3Q9DAU1 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cnpy3Q9DAU1 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cnpy3Q9DAU1 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cnpy3Q9DAU1 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cnpy3Q9DAU1 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cnpy3Q9DAU1 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cnpy3Q9DAU1 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cnpy3Q9DAU1 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Cnpy3Q9DAU1 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cnpy3Q9DAU1 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cnpy3Q9DAU1 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Cnpy3Q9DAU1 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cnpy3Q9DAU1 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cnpy3Q9DAU1 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cnpy3Q9DAU1 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cnpy3Q9DAU1 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Cnpy3Q9DAU1 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Cnpy3Q9DAU1 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cnpy3Q9DAU1 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Cnpy3Q9DAU1 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cnpy3Q9DAU1 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cnpy3Q9DAU1 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cnpy3Q9DAU1 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cnpy3Q9DAU1 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cnpy3Q9DAU1 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cnpy3Q9DAU1 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cnpy3Q9DAU1 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cnpy3Q9DAU1 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cnpy3Q9DAU1 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cnpy3Q9DAU1 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cnpy3Q9DAU1 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cnpy3Q9DAU1 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cnpy3Q9DAU1 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cnpy3Q9DAU1 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cnpy3Q9DAU1 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cnpy3Q9DAU1 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cnpy3Q9DAU1 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cnpy3Q9DAU1 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cnpy3Q9DAU1 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cnpy3Q9DAU1 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cnpy3Q9DAU1 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cnpy3Q9DAU1 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cnpy3Q9DAU1 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cnpy3Q9DAU1 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cnpy3Q9DAU1 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cnpy3Q9DAU1 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cnpy3Q9DAU1 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cnpy3Q9DAU1 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cnpy3Q9DAU1 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cnpy3Q9DAU1 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cnpy3Q9DAU1 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cnpy3Q9DAU1 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cnpy3Q9DAU1 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cnpy3Q9DAU1 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cnpy3Q9DAU1 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cnpy3Q9DAU1 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cnpy3Q9DAU1 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cnpy3Q9DAU1 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cnpy3Q9DAU1 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cnpy3Q9DAU1 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cnpy3Q9DAU1 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cnpy3Q9DAU1 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cnpy3Q9DAU1 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cnpy3Q9DAU1 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cnpy3Q9DAU1 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cnpy3Q9DAU1 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cnpy3Q9DAU1 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cnpy3Q9DAU1 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cnpy3Q9DAU1 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cnpy3Q9DAU1 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cnpy3Q9DAU1 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cnpy3Q9DAU1 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cnpy3Q9DAU1 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cnpy3Q9DAU1 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Cnpy3Q9DAU1 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cnpy3Q9DAU1 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cnpy3Q9DAU1 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cnpy3Q9DAU1 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cnpy3Q9DAU1 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cnpy3Q9DAU1 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cnpy3Q9DAU1 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cnpy3Q9DAU1 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cnpy3Q9DAU1 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cnpy3Q9DAU1 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cnpy3Q9DAU1 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cnpy3Q9DAU1 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cnpy3Q9DAU1 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cnpy3Q9DAU1 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cnpy3Q9DAU1 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cnpy3Q9DAU1 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cnpy3Q9DAU1 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cnpy3Q9DAU1 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cnpy3Q9DAU1 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cnpy3Q9DAU1 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cnpy3Q9DAU1 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cnpy3Q9DAU1 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cnpy3Q9DAU1 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms