Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAP7

Asf1b, Histone chaperone ASF1B, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Asf1bQ9DAP7 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Asf1bQ9DAP7 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Asf1bQ9DAP7 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Asf1bQ9DAP7 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Asf1bQ9DAP7 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Asf1bQ9DAP7 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Asf1bQ9DAP7 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Asf1bQ9DAP7 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Asf1bQ9DAP7 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Asf1bQ9DAP7 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Asf1bQ9DAP7 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Asf1bQ9DAP7 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Asf1bQ9DAP7 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Asf1bQ9DAP7 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Asf1bQ9DAP7 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Asf1bQ9DAP7 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Asf1bQ9DAP7 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Asf1bQ9DAP7 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Asf1bQ9DAP7 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Asf1bQ9DAP7 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Asf1bQ9DAP7 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Asf1bQ9DAP7 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Asf1bQ9DAP7 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Asf1bQ9DAP7 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Asf1bQ9DAP7 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Asf1bQ9DAP7 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Asf1bQ9DAP7 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Asf1bQ9DAP7 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Asf1bQ9DAP7 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Asf1bQ9DAP7 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Asf1bQ9DAP7 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Asf1bQ9DAP7 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Asf1bQ9DAP7 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Asf1bQ9DAP7 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Asf1bQ9DAP7 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Asf1bQ9DAP7 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Asf1bQ9DAP7 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Asf1bQ9DAP7 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Asf1bQ9DAP7 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Asf1bQ9DAP7 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Asf1bQ9DAP7 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Asf1bQ9DAP7 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Asf1bQ9DAP7 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Asf1bQ9DAP7 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Asf1bQ9DAP7 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Asf1bQ9DAP7 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Asf1bQ9DAP7 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Asf1bQ9DAP7 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Asf1bQ9DAP7 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Asf1bQ9DAP7 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Asf1bQ9DAP7 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Asf1bQ9DAP7 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Asf1bQ9DAP7 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Asf1bQ9DAP7 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Asf1bQ9DAP7 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Asf1bQ9DAP7 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Asf1bQ9DAP7 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Asf1bQ9DAP7 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Asf1bQ9DAP7 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Asf1bQ9DAP7 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Asf1bQ9DAP7 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Asf1bQ9DAP7 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Asf1bQ9DAP7 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Asf1bQ9DAP7 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Asf1bQ9DAP7 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Asf1bQ9DAP7 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Asf1bQ9DAP7 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Asf1bQ9DAP7 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Asf1bQ9DAP7 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Asf1bQ9DAP7 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Asf1bQ9DAP7 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Asf1bQ9DAP7 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Asf1bQ9DAP7 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Asf1bQ9DAP7 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Asf1bQ9DAP7 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Asf1bQ9DAP7 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Asf1bQ9DAP7 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Asf1bQ9DAP7 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Asf1bQ9DAP7 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Asf1bQ9DAP7 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Asf1bQ9DAP7 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Asf1bQ9DAP7 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Asf1bQ9DAP7 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Asf1bQ9DAP7 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Asf1bQ9DAP7 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Asf1bQ9DAP7 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Asf1bQ9DAP7 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Asf1bQ9DAP7 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Asf1bQ9DAP7 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Asf1bQ9DAP7 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Asf1bQ9DAP7 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Asf1bQ9DAP7 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Asf1bQ9DAP7 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Asf1bQ9DAP7 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Asf1bQ9DAP7 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Asf1bQ9DAP7 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Asf1bQ9DAP7 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Asf1bQ9DAP7 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Asf1bQ9DAP7 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Asf1bQ9DAP7 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.7 ms