Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAL3

Ccdc54, Coiled-coil domain-containing protein 54, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc54Q9DAL3 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc54Q9DAL3 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc54Q9DAL3 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc54Q9DAL3 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc54Q9DAL3 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc54Q9DAL3 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc54Q9DAL3 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc54Q9DAL3 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc54Q9DAL3 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc54Q9DAL3 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc54Q9DAL3 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc54Q9DAL3 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc54Q9DAL3 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc54Q9DAL3 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc54Q9DAL3 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc54Q9DAL3 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc54Q9DAL3 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc54Q9DAL3 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc54Q9DAL3 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc54Q9DAL3 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc54Q9DAL3 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc54Q9DAL3 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc54Q9DAL3 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc54Q9DAL3 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc54Q9DAL3 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc54Q9DAL3 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc54Q9DAL3 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc54Q9DAL3 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc54Q9DAL3 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc54Q9DAL3 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.14
Ccdc54Q9DAL3 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc54Q9DAL3 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc54Q9DAL3 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc54Q9DAL3 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc54Q9DAL3 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc54Q9DAL3 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc54Q9DAL3 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc54Q9DAL3 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc54Q9DAL3 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc54Q9DAL3 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc54Q9DAL3 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc54Q9DAL3 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc54Q9DAL3 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc54Q9DAL3 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc54Q9DAL3 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc54Q9DAL3 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc54Q9DAL3 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc54Q9DAL3 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc54Q9DAL3 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc54Q9DAL3 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc54Q9DAL3 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc54Q9DAL3 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc54Q9DAL3 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc54Q9DAL3 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc54Q9DAL3 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc54Q9DAL3 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc54Q9DAL3 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc54Q9DAL3 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc54Q9DAL3 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc54Q9DAL3 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc54Q9DAL3 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc54Q9DAL3 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc54Q9DAL3 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc54Q9DAL3 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc54Q9DAL3 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc54Q9DAL3 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc54Q9DAL3 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc54Q9DAL3 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc54Q9DAL3 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc54Q9DAL3 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc54Q9DAL3 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc54Q9DAL3 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc54Q9DAL3 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc54Q9DAL3 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc54Q9DAL3 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc54Q9DAL3 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc54Q9DAL3 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc54Q9DAL3 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc54Q9DAL3 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc54Q9DAL3 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc54Q9DAL3 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc54Q9DAL3 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc54Q9DAL3 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc54Q9DAL3 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc54Q9DAL3 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc54Q9DAL3 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc54Q9DAL3 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc54Q9DAL3 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc54Q9DAL3 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc54Q9DAL3 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc54Q9DAL3 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc54Q9DAL3 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc54Q9DAL3 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc54Q9DAL3 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc54Q9DAL3 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc54Q9DAL3 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc54Q9DAL3 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc54Q9DAL3 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc54Q9DAL3 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc54Q9DAL3 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.5 ms