Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA73

Ccdc89, Coiled-coil domain-containing protein 89, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc89Q9DA73 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc89Q9DA73 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc89Q9DA73 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc89Q9DA73 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc89Q9DA73 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc89Q9DA73 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc89Q9DA73 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc89Q9DA73 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc89Q9DA73 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc89Q9DA73 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc89Q9DA73 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc89Q9DA73 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc89Q9DA73 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc89Q9DA73 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc89Q9DA73 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc89Q9DA73 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc89Q9DA73 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc89Q9DA73 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc89Q9DA73 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc89Q9DA73 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc89Q9DA73 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc89Q9DA73 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc89Q9DA73 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc89Q9DA73 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc89Q9DA73 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc89Q9DA73 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc89Q9DA73 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc89Q9DA73 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc89Q9DA73 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc89Q9DA73 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc89Q9DA73 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc89Q9DA73 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc89Q9DA73 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc89Q9DA73 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc89Q9DA73 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc89Q9DA73 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc89Q9DA73 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc89Q9DA73 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc89Q9DA73 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc89Q9DA73 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc89Q9DA73 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc89Q9DA73 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc89Q9DA73 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc89Q9DA73 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc89Q9DA73 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc89Q9DA73 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc89Q9DA73 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc89Q9DA73 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc89Q9DA73 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc89Q9DA73 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc89Q9DA73 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc89Q9DA73 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc89Q9DA73 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc89Q9DA73 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc89Q9DA73 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc89Q9DA73 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc89Q9DA73 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc89Q9DA73 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc89Q9DA73 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc89Q9DA73 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc89Q9DA73 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc89Q9DA73 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc89Q9DA73 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc89Q9DA73 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc89Q9DA73 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc89Q9DA73 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc89Q9DA73 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc89Q9DA73 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc89Q9DA73 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc89Q9DA73 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc89Q9DA73 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc89Q9DA73 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc89Q9DA73 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc89Q9DA73 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc89Q9DA73 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc89Q9DA73 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Ccdc89Q9DA73 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Ccdc89Q9DA73 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Ccdc89Q9DA73 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Ccdc89Q9DA73 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc89Q9DA73 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc89Q9DA73 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc89Q9DA73 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc89Q9DA73 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc89Q9DA73 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc89Q9DA73 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc89Q9DA73 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc89Q9DA73 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc89Q9DA73 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc89Q9DA73 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc89Q9DA73 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc89Q9DA73 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc89Q9DA73 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc89Q9DA73 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc89Q9DA73 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc89Q9DA73 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc89Q9DA73 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc89Q9DA73 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc89Q9DA73 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc89Q9DA73 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms