Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA21

Smco2, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smco2Q9DA21 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Smco2Q9DA21 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Smco2Q9DA21 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Smco2Q9DA21 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Smco2Q9DA21 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Smco2Q9DA21 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Smco2Q9DA21 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Smco2Q9DA21 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Smco2Q9DA21 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Smco2Q9DA21 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Smco2Q9DA21 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Smco2Q9DA21 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Smco2Q9DA21 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Smco2Q9DA21 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Smco2Q9DA21 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Smco2Q9DA21 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Smco2Q9DA21 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Smco2Q9DA21 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Smco2Q9DA21 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Smco2Q9DA21 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Smco2Q9DA21 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Smco2Q9DA21 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Smco2Q9DA21 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Smco2Q9DA21 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Smco2Q9DA21 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Smco2Q9DA21 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Smco2Q9DA21 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Smco2Q9DA21 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Smco2Q9DA21 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Smco2Q9DA21 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Smco2Q9DA21 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Smco2Q9DA21 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Smco2Q9DA21 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Smco2Q9DA21 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Smco2Q9DA21 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Smco2Q9DA21 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Smco2Q9DA21 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Smco2Q9DA21 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Smco2Q9DA21 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Smco2Q9DA21 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Smco2Q9DA21 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Smco2Q9DA21 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Smco2Q9DA21 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Smco2Q9DA21 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Smco2Q9DA21 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Smco2Q9DA21 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Smco2Q9DA21 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Smco2Q9DA21 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Smco2Q9DA21 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Smco2Q9DA21 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Smco2Q9DA21 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Smco2Q9DA21 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Smco2Q9DA21 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Smco2Q9DA21 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Smco2Q9DA21 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Smco2Q9DA21 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Smco2Q9DA21 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Smco2Q9DA21 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Smco2Q9DA21 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Smco2Q9DA21 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Smco2Q9DA21 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Smco2Q9DA21 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Smco2Q9DA21 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Smco2Q9DA21 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Smco2Q9DA21 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Smco2Q9DA21 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Smco2Q9DA21 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Smco2Q9DA21 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Smco2Q9DA21 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Smco2Q9DA21 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Smco2Q9DA21 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Smco2Q9DA21 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Smco2Q9DA21 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Smco2Q9DA21 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Smco2Q9DA21 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Smco2Q9DA21 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Smco2Q9DA21 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Smco2Q9DA21 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Smco2Q9DA21 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Smco2Q9DA21 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Smco2Q9DA21 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Smco2Q9DA21 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Smco2Q9DA21 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Smco2Q9DA21 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Smco2Q9DA21 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Smco2Q9DA21 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Smco2Q9DA21 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Smco2Q9DA21 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Smco2Q9DA21 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Smco2Q9DA21 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Smco2Q9DA21 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Smco2Q9DA21 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Smco2Q9DA21 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Smco2Q9DA21 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Smco2Q9DA21 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Smco2Q9DA21 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Smco2Q9DA21 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Smco2Q9DA21 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Smco2Q9DA21 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Smco2Q9DA21 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms