Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9Z1

Knstrn, Small kinetochore-associated protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 312 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KnstrnQ9D9Z1 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
KnstrnQ9D9Z1 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KnstrnQ9D9Z1 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KnstrnQ9D9Z1 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KnstrnQ9D9Z1 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KnstrnQ9D9Z1 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KnstrnQ9D9Z1 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KnstrnQ9D9Z1 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KnstrnQ9D9Z1 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KnstrnQ9D9Z1 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KnstrnQ9D9Z1 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KnstrnQ9D9Z1 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
KnstrnQ9D9Z1 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KnstrnQ9D9Z1 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KnstrnQ9D9Z1 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KnstrnQ9D9Z1 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KnstrnQ9D9Z1 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KnstrnQ9D9Z1 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KnstrnQ9D9Z1 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KnstrnQ9D9Z1 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KnstrnQ9D9Z1 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KnstrnQ9D9Z1 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KnstrnQ9D9Z1 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KnstrnQ9D9Z1 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KnstrnQ9D9Z1 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KnstrnQ9D9Z1 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KnstrnQ9D9Z1 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KnstrnQ9D9Z1 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KnstrnQ9D9Z1 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KnstrnQ9D9Z1 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KnstrnQ9D9Z1 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KnstrnQ9D9Z1 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KnstrnQ9D9Z1 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KnstrnQ9D9Z1 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KnstrnQ9D9Z1 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KnstrnQ9D9Z1 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KnstrnQ9D9Z1 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KnstrnQ9D9Z1 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
KnstrnQ9D9Z1 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
KnstrnQ9D9Z1 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KnstrnQ9D9Z1 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KnstrnQ9D9Z1 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KnstrnQ9D9Z1 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KnstrnQ9D9Z1 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KnstrnQ9D9Z1 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KnstrnQ9D9Z1 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
KnstrnQ9D9Z1 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KnstrnQ9D9Z1 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KnstrnQ9D9Z1 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
KnstrnQ9D9Z1 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
KnstrnQ9D9Z1 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KnstrnQ9D9Z1 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KnstrnQ9D9Z1 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KnstrnQ9D9Z1 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KnstrnQ9D9Z1 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KnstrnQ9D9Z1 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KnstrnQ9D9Z1 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KnstrnQ9D9Z1 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KnstrnQ9D9Z1 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KnstrnQ9D9Z1 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KnstrnQ9D9Z1 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KnstrnQ9D9Z1 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KnstrnQ9D9Z1 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KnstrnQ9D9Z1 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KnstrnQ9D9Z1 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KnstrnQ9D9Z1 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KnstrnQ9D9Z1 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KnstrnQ9D9Z1 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KnstrnQ9D9Z1 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KnstrnQ9D9Z1 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KnstrnQ9D9Z1 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KnstrnQ9D9Z1 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KnstrnQ9D9Z1 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KnstrnQ9D9Z1 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KnstrnQ9D9Z1 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KnstrnQ9D9Z1 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KnstrnQ9D9Z1 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KnstrnQ9D9Z1 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
KnstrnQ9D9Z1 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KnstrnQ9D9Z1 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KnstrnQ9D9Z1 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KnstrnQ9D9Z1 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KnstrnQ9D9Z1 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KnstrnQ9D9Z1 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
KnstrnQ9D9Z1 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KnstrnQ9D9Z1 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KnstrnQ9D9Z1 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KnstrnQ9D9Z1 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KnstrnQ9D9Z1 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KnstrnQ9D9Z1 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KnstrnQ9D9Z1 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KnstrnQ9D9Z1 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KnstrnQ9D9Z1 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
KnstrnQ9D9Z1 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KnstrnQ9D9Z1 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KnstrnQ9D9Z1 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
KnstrnQ9D9Z1 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KnstrnQ9D9Z1 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KnstrnQ9D9Z1 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KnstrnQ9D9Z1 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.7 ms