Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9F7

Speer4b, Spermatogenesis-associated glutamate (E)-rich protein 4B, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer4bQ9D9F7 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Speer4bQ9D9F7 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Speer4bQ9D9F7 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Speer4bQ9D9F7 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Speer4bQ9D9F7 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Speer4bQ9D9F7 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Speer4bQ9D9F7 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Speer4bQ9D9F7 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Speer4bQ9D9F7 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Speer4bQ9D9F7 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Speer4bQ9D9F7 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Speer4bQ9D9F7 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Speer4bQ9D9F7 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Speer4bQ9D9F7 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Speer4bQ9D9F7 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Speer4bQ9D9F7 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Speer4bQ9D9F7 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Speer4bQ9D9F7 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Speer4bQ9D9F7 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Speer4bQ9D9F7 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Speer4bQ9D9F7 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Speer4bQ9D9F7 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Speer4bQ9D9F7 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Speer4bQ9D9F7 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Speer4bQ9D9F7 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Speer4bQ9D9F7 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Speer4bQ9D9F7 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Speer4bQ9D9F7 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Speer4bQ9D9F7 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Speer4bQ9D9F7 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Speer4bQ9D9F7 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Speer4bQ9D9F7 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Speer4bQ9D9F7 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Speer4bQ9D9F7 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Speer4bQ9D9F7 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Speer4bQ9D9F7 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Speer4bQ9D9F7 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Speer4bQ9D9F7 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Speer4bQ9D9F7 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Speer4bQ9D9F7 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Speer4bQ9D9F7 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Speer4bQ9D9F7 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Speer4bQ9D9F7 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Speer4bQ9D9F7 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Speer4bQ9D9F7 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Speer4bQ9D9F7 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Speer4bQ9D9F7 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Speer4bQ9D9F7 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Speer4bQ9D9F7 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Speer4bQ9D9F7 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Speer4bQ9D9F7 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Speer4bQ9D9F7 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Speer4bQ9D9F7 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Speer4bQ9D9F7 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Speer4bQ9D9F7 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Speer4bQ9D9F7 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Speer4bQ9D9F7 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Speer4bQ9D9F7 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Speer4bQ9D9F7 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Speer4bQ9D9F7 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Speer4bQ9D9F7 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Speer4bQ9D9F7 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Speer4bQ9D9F7 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Speer4bQ9D9F7 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Speer4bQ9D9F7 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Speer4bQ9D9F7 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Speer4bQ9D9F7 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Speer4bQ9D9F7 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Speer4bQ9D9F7 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Speer4bQ9D9F7 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Speer4bQ9D9F7 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Speer4bQ9D9F7 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Speer4bQ9D9F7 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Speer4bQ9D9F7 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Speer4bQ9D9F7 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Speer4bQ9D9F7 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Speer4bQ9D9F7 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Speer4bQ9D9F7 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Speer4bQ9D9F7 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Speer4bQ9D9F7 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Speer4bQ9D9F7 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Speer4bQ9D9F7 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Speer4bQ9D9F7 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Speer4bQ9D9F7 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Speer4bQ9D9F7 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Speer4bQ9D9F7 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Speer4bQ9D9F7 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Speer4bQ9D9F7 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Speer4bQ9D9F7 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Speer4bQ9D9F7 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Speer4bQ9D9F7 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Speer4bQ9D9F7 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Speer4bQ9D9F7 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Speer4bQ9D9F7 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Speer4bQ9D9F7 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Speer4bQ9D9F7 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Speer4bQ9D9F7 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Speer4bQ9D9F7 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Speer4bQ9D9F7 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Speer4bQ9D9F7 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms