Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9B7

Prr30, Proline-rich protein 30, mousemouse

Predictions only

Length 401 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr30Q9D9B7 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Prr30Q9D9B7 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Prr30Q9D9B7 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Prr30Q9D9B7 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Prr30Q9D9B7 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prr30Q9D9B7 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Prr30Q9D9B7 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prr30Q9D9B7 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prr30Q9D9B7 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prr30Q9D9B7 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prr30Q9D9B7 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Prr30Q9D9B7 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Prr30Q9D9B7 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prr30Q9D9B7 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prr30Q9D9B7 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prr30Q9D9B7 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prr30Q9D9B7 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Prr30Q9D9B7 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prr30Q9D9B7 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prr30Q9D9B7 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prr30Q9D9B7 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prr30Q9D9B7 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prr30Q9D9B7 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Prr30Q9D9B7 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prr30Q9D9B7 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prr30Q9D9B7 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prr30Q9D9B7 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prr30Q9D9B7 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prr30Q9D9B7 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prr30Q9D9B7 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prr30Q9D9B7 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prr30Q9D9B7 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Prr30Q9D9B7 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Prr30Q9D9B7 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Prr30Q9D9B7 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prr30Q9D9B7 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prr30Q9D9B7 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prr30Q9D9B7 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prr30Q9D9B7 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prr30Q9D9B7 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prr30Q9D9B7 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prr30Q9D9B7 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prr30Q9D9B7 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prr30Q9D9B7 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prr30Q9D9B7 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prr30Q9D9B7 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prr30Q9D9B7 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prr30Q9D9B7 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prr30Q9D9B7 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prr30Q9D9B7 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prr30Q9D9B7 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prr30Q9D9B7 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Prr30Q9D9B7 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Prr30Q9D9B7 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prr30Q9D9B7 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prr30Q9D9B7 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prr30Q9D9B7 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prr30Q9D9B7 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prr30Q9D9B7 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prr30Q9D9B7 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prr30Q9D9B7 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prr30Q9D9B7 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prr30Q9D9B7 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prr30Q9D9B7 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prr30Q9D9B7 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prr30Q9D9B7 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prr30Q9D9B7 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Prr30Q9D9B7 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prr30Q9D9B7 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prr30Q9D9B7 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prr30Q9D9B7 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prr30Q9D9B7 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prr30Q9D9B7 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prr30Q9D9B7 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prr30Q9D9B7 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prr30Q9D9B7 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prr30Q9D9B7 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prr30Q9D9B7 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prr30Q9D9B7 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prr30Q9D9B7 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prr30Q9D9B7 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prr30Q9D9B7 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prr30Q9D9B7 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms