Protein–RNA interactions for Protein: Q9D902

Gtf2e2, General transcription factor IIE subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2e2Q9D902 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gtf2e2Q9D902 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gtf2e2Q9D902 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gtf2e2Q9D902 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gtf2e2Q9D902 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gtf2e2Q9D902 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gtf2e2Q9D902 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gtf2e2Q9D902 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gtf2e2Q9D902 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gtf2e2Q9D902 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gtf2e2Q9D902 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gtf2e2Q9D902 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gtf2e2Q9D902 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gtf2e2Q9D902 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gtf2e2Q9D902 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gtf2e2Q9D902 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gtf2e2Q9D902 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gtf2e2Q9D902 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Gtf2e2Q9D902 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gtf2e2Q9D902 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gtf2e2Q9D902 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gtf2e2Q9D902 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gtf2e2Q9D902 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gtf2e2Q9D902 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gtf2e2Q9D902 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gtf2e2Q9D902 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gtf2e2Q9D902 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gtf2e2Q9D902 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gtf2e2Q9D902 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Gtf2e2Q9D902 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gtf2e2Q9D902 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gtf2e2Q9D902 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gtf2e2Q9D902 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gtf2e2Q9D902 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gtf2e2Q9D902 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gtf2e2Q9D902 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Gtf2e2Q9D902 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Gtf2e2Q9D902 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gtf2e2Q9D902 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gtf2e2Q9D902 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gtf2e2Q9D902 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gtf2e2Q9D902 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gtf2e2Q9D902 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gtf2e2Q9D902 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gtf2e2Q9D902 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gtf2e2Q9D902 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Gtf2e2Q9D902 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gtf2e2Q9D902 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gtf2e2Q9D902 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gtf2e2Q9D902 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gtf2e2Q9D902 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gtf2e2Q9D902 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gtf2e2Q9D902 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gtf2e2Q9D902 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gtf2e2Q9D902 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gtf2e2Q9D902 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gtf2e2Q9D902 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gtf2e2Q9D902 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gtf2e2Q9D902 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gtf2e2Q9D902 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gtf2e2Q9D902 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Gtf2e2Q9D902 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gtf2e2Q9D902 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gtf2e2Q9D902 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gtf2e2Q9D902 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Gtf2e2Q9D902 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gtf2e2Q9D902 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gtf2e2Q9D902 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gtf2e2Q9D902 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gtf2e2Q9D902 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gtf2e2Q9D902 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gtf2e2Q9D902 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gtf2e2Q9D902 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gtf2e2Q9D902 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Gtf2e2Q9D902 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gtf2e2Q9D902 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gtf2e2Q9D902 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gtf2e2Q9D902 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gtf2e2Q9D902 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gtf2e2Q9D902 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gtf2e2Q9D902 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gtf2e2Q9D902 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gtf2e2Q9D902 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gtf2e2Q9D902 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gtf2e2Q9D902 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gtf2e2Q9D902 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gtf2e2Q9D902 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gtf2e2Q9D902 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gtf2e2Q9D902 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gtf2e2Q9D902 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gtf2e2Q9D902 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gtf2e2Q9D902 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gtf2e2Q9D902 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gtf2e2Q9D902 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gtf2e2Q9D902 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gtf2e2Q9D902 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gtf2e2Q9D902 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gtf2e2Q9D902 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Gtf2e2Q9D902 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gtf2e2Q9D902 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms