Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8T7

Slirp, SRA stem-loop-interacting RNA-binding protein, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 112 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SlirpQ9D8T7 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SlirpQ9D8T7 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SlirpQ9D8T7 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SlirpQ9D8T7 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SlirpQ9D8T7 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SlirpQ9D8T7 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SlirpQ9D8T7 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SlirpQ9D8T7 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SlirpQ9D8T7 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SlirpQ9D8T7 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SlirpQ9D8T7 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SlirpQ9D8T7 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SlirpQ9D8T7 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SlirpQ9D8T7 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SlirpQ9D8T7 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SlirpQ9D8T7 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SlirpQ9D8T7 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SlirpQ9D8T7 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SlirpQ9D8T7 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SlirpQ9D8T7 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SlirpQ9D8T7 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SlirpQ9D8T7 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SlirpQ9D8T7 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SlirpQ9D8T7 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SlirpQ9D8T7 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SlirpQ9D8T7 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SlirpQ9D8T7 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SlirpQ9D8T7 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SlirpQ9D8T7 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SlirpQ9D8T7 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SlirpQ9D8T7 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SlirpQ9D8T7 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SlirpQ9D8T7 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SlirpQ9D8T7 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SlirpQ9D8T7 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SlirpQ9D8T7 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SlirpQ9D8T7 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SlirpQ9D8T7 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SlirpQ9D8T7 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SlirpQ9D8T7 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SlirpQ9D8T7 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SlirpQ9D8T7 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SlirpQ9D8T7 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SlirpQ9D8T7 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SlirpQ9D8T7 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SlirpQ9D8T7 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SlirpQ9D8T7 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SlirpQ9D8T7 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SlirpQ9D8T7 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SlirpQ9D8T7 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SlirpQ9D8T7 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SlirpQ9D8T7 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SlirpQ9D8T7 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SlirpQ9D8T7 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SlirpQ9D8T7 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SlirpQ9D8T7 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SlirpQ9D8T7 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SlirpQ9D8T7 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SlirpQ9D8T7 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SlirpQ9D8T7 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SlirpQ9D8T7 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SlirpQ9D8T7 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SlirpQ9D8T7 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SlirpQ9D8T7 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SlirpQ9D8T7 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SlirpQ9D8T7 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SlirpQ9D8T7 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SlirpQ9D8T7 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SlirpQ9D8T7 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SlirpQ9D8T7 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SlirpQ9D8T7 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SlirpQ9D8T7 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SlirpQ9D8T7 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SlirpQ9D8T7 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SlirpQ9D8T7 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SlirpQ9D8T7 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SlirpQ9D8T7 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SlirpQ9D8T7 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SlirpQ9D8T7 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SlirpQ9D8T7 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SlirpQ9D8T7 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SlirpQ9D8T7 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SlirpQ9D8T7 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SlirpQ9D8T7 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SlirpQ9D8T7 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SlirpQ9D8T7 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SlirpQ9D8T7 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SlirpQ9D8T7 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SlirpQ9D8T7 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SlirpQ9D8T7 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SlirpQ9D8T7 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SlirpQ9D8T7 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SlirpQ9D8T7 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SlirpQ9D8T7 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SlirpQ9D8T7 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SlirpQ9D8T7 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SlirpQ9D8T7 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SlirpQ9D8T7 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SlirpQ9D8T7 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SlirpQ9D8T7 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms