Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8N1

Uncharacterized protein C11orf24 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 392 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D8N1 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q9D8N1 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q9D8N1 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q9D8N1 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q9D8N1 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q9D8N1 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q9D8N1 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q9D8N1 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q9D8N1 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q9D8N1 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q9D8N1 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q9D8N1 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q9D8N1 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q9D8N1 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q9D8N1 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q9D8N1 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q9D8N1 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q9D8N1 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q9D8N1 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q9D8N1 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q9D8N1 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Q9D8N1 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q9D8N1 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q9D8N1 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q9D8N1 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q9D8N1 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q9D8N1 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q9D8N1 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q9D8N1 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q9D8N1 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q9D8N1 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q9D8N1 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q9D8N1 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q9D8N1 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q9D8N1 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Q9D8N1 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q9D8N1 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q9D8N1 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q9D8N1 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q9D8N1 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q9D8N1 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Q9D8N1 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q9D8N1 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q9D8N1 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q9D8N1 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q9D8N1 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q9D8N1 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q9D8N1 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q9D8N1 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Q9D8N1 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q9D8N1 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q9D8N1 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q9D8N1 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q9D8N1 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q9D8N1 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q9D8N1 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q9D8N1 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q9D8N1 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q9D8N1 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q9D8N1 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q9D8N1 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q9D8N1 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q9D8N1 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q9D8N1 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q9D8N1 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q9D8N1 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q9D8N1 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q9D8N1 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q9D8N1 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q9D8N1 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q9D8N1 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q9D8N1 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q9D8N1 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q9D8N1 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q9D8N1 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q9D8N1 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Q9D8N1 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Q9D8N1 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q9D8N1 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q9D8N1 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q9D8N1 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q9D8N1 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q9D8N1 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q9D8N1 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q9D8N1 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q9D8N1 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q9D8N1 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q9D8N1 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q9D8N1 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q9D8N1 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q9D8N1 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q9D8N1 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q9D8N1 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q9D8N1 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q9D8N1 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q9D8N1 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q9D8N1 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q9D8N1 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q9D8N1 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q9D8N1 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms