Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8F1

Alkbh4, Alpha-ketoglutarate-dependent dioxygenase alkB homolog 4, mousemouse

Predictions only

Length 300 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alkbh4Q9D8F1 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Alkbh4Q9D8F1 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Alkbh4Q9D8F1 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Alkbh4Q9D8F1 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Alkbh4Q9D8F1 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Alkbh4Q9D8F1 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Alkbh4Q9D8F1 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Alkbh4Q9D8F1 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Alkbh4Q9D8F1 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Alkbh4Q9D8F1 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Alkbh4Q9D8F1 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Alkbh4Q9D8F1 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Alkbh4Q9D8F1 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Alkbh4Q9D8F1 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Alkbh4Q9D8F1 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Alkbh4Q9D8F1 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Alkbh4Q9D8F1 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Alkbh4Q9D8F1 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Alkbh4Q9D8F1 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Alkbh4Q9D8F1 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Alkbh4Q9D8F1 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Alkbh4Q9D8F1 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Alkbh4Q9D8F1 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Alkbh4Q9D8F1 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Alkbh4Q9D8F1 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Alkbh4Q9D8F1 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Alkbh4Q9D8F1 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Alkbh4Q9D8F1 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Alkbh4Q9D8F1 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Alkbh4Q9D8F1 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Alkbh4Q9D8F1 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Alkbh4Q9D8F1 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Alkbh4Q9D8F1 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Alkbh4Q9D8F1 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Alkbh4Q9D8F1 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Alkbh4Q9D8F1 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Alkbh4Q9D8F1 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Alkbh4Q9D8F1 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Alkbh4Q9D8F1 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Alkbh4Q9D8F1 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Alkbh4Q9D8F1 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Alkbh4Q9D8F1 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Alkbh4Q9D8F1 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Alkbh4Q9D8F1 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Alkbh4Q9D8F1 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Alkbh4Q9D8F1 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Alkbh4Q9D8F1 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Alkbh4Q9D8F1 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Alkbh4Q9D8F1 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Alkbh4Q9D8F1 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Alkbh4Q9D8F1 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Alkbh4Q9D8F1 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Alkbh4Q9D8F1 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Alkbh4Q9D8F1 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Alkbh4Q9D8F1 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Alkbh4Q9D8F1 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Alkbh4Q9D8F1 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Alkbh4Q9D8F1 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Alkbh4Q9D8F1 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Alkbh4Q9D8F1 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Alkbh4Q9D8F1 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Alkbh4Q9D8F1 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Alkbh4Q9D8F1 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Alkbh4Q9D8F1 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Alkbh4Q9D8F1 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Alkbh4Q9D8F1 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Alkbh4Q9D8F1 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Alkbh4Q9D8F1 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Alkbh4Q9D8F1 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Alkbh4Q9D8F1 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Alkbh4Q9D8F1 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Alkbh4Q9D8F1 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Alkbh4Q9D8F1 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Alkbh4Q9D8F1 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Alkbh4Q9D8F1 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Alkbh4Q9D8F1 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Alkbh4Q9D8F1 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Alkbh4Q9D8F1 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Alkbh4Q9D8F1 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Alkbh4Q9D8F1 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Alkbh4Q9D8F1 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Alkbh4Q9D8F1 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Alkbh4Q9D8F1 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Alkbh4Q9D8F1 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Alkbh4Q9D8F1 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Alkbh4Q9D8F1 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Alkbh4Q9D8F1 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Alkbh4Q9D8F1 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Alkbh4Q9D8F1 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Alkbh4Q9D8F1 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Alkbh4Q9D8F1 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Alkbh4Q9D8F1 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Alkbh4Q9D8F1 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Alkbh4Q9D8F1 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Alkbh4Q9D8F1 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Alkbh4Q9D8F1 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Alkbh4Q9D8F1 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Alkbh4Q9D8F1 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Alkbh4Q9D8F1 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Alkbh4Q9D8F1 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms