Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8E6

Rpl4, 60S ribosomal protein L4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl4Q9D8E6 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rpl4Q9D8E6 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rpl4Q9D8E6 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rpl4Q9D8E6 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rpl4Q9D8E6 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rpl4Q9D8E6 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rpl4Q9D8E6 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rpl4Q9D8E6 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rpl4Q9D8E6 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rpl4Q9D8E6 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rpl4Q9D8E6 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rpl4Q9D8E6 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rpl4Q9D8E6 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rpl4Q9D8E6 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rpl4Q9D8E6 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rpl4Q9D8E6 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rpl4Q9D8E6 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rpl4Q9D8E6 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rpl4Q9D8E6 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rpl4Q9D8E6 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rpl4Q9D8E6 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rpl4Q9D8E6 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rpl4Q9D8E6 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rpl4Q9D8E6 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rpl4Q9D8E6 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rpl4Q9D8E6 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rpl4Q9D8E6 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rpl4Q9D8E6 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rpl4Q9D8E6 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rpl4Q9D8E6 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rpl4Q9D8E6 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rpl4Q9D8E6 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rpl4Q9D8E6 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rpl4Q9D8E6 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rpl4Q9D8E6 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rpl4Q9D8E6 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Rpl4Q9D8E6 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Rpl4Q9D8E6 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Rpl4Q9D8E6 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rpl4Q9D8E6 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rpl4Q9D8E6 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rpl4Q9D8E6 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rpl4Q9D8E6 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rpl4Q9D8E6 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rpl4Q9D8E6 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rpl4Q9D8E6 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rpl4Q9D8E6 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rpl4Q9D8E6 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rpl4Q9D8E6 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rpl4Q9D8E6 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rpl4Q9D8E6 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rpl4Q9D8E6 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rpl4Q9D8E6 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rpl4Q9D8E6 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rpl4Q9D8E6 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Rpl4Q9D8E6 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rpl4Q9D8E6 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rpl4Q9D8E6 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rpl4Q9D8E6 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rpl4Q9D8E6 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rpl4Q9D8E6 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rpl4Q9D8E6 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rpl4Q9D8E6 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rpl4Q9D8E6 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rpl4Q9D8E6 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rpl4Q9D8E6 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rpl4Q9D8E6 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rpl4Q9D8E6 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rpl4Q9D8E6 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rpl4Q9D8E6 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rpl4Q9D8E6 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rpl4Q9D8E6 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rpl4Q9D8E6 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rpl4Q9D8E6 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rpl4Q9D8E6 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rpl4Q9D8E6 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rpl4Q9D8E6 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rpl4Q9D8E6 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rpl4Q9D8E6 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rpl4Q9D8E6 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rpl4Q9D8E6 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rpl4Q9D8E6 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rpl4Q9D8E6 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rpl4Q9D8E6 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Rpl4Q9D8E6 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rpl4Q9D8E6 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rpl4Q9D8E6 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rpl4Q9D8E6 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rpl4Q9D8E6 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rpl4Q9D8E6 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Rpl4Q9D8E6 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rpl4Q9D8E6 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Rpl4Q9D8E6 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rpl4Q9D8E6 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rpl4Q9D8E6 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Rpl4Q9D8E6 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rpl4Q9D8E6 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rpl4Q9D8E6 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rpl4Q9D8E6 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rpl4Q9D8E6 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms