Protein–RNA interactions for Protein: Q9D824

Fip1l1, Pre-mRNA 3'-end-processing factor FIP1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fip1l1Q9D824 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Fip1l1Q9D824 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Fip1l1Q9D824 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Fip1l1Q9D824 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Fip1l1Q9D824 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Fip1l1Q9D824 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Fip1l1Q9D824 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Fip1l1Q9D824 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Fip1l1Q9D824 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Fip1l1Q9D824 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Fip1l1Q9D824 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Fip1l1Q9D824 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Fip1l1Q9D824 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Fip1l1Q9D824 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Fip1l1Q9D824 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Fip1l1Q9D824 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Fip1l1Q9D824 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Fip1l1Q9D824 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Fip1l1Q9D824 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Fip1l1Q9D824 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Fip1l1Q9D824 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Fip1l1Q9D824 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Fip1l1Q9D824 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Fip1l1Q9D824 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Fip1l1Q9D824 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Fip1l1Q9D824 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Fip1l1Q9D824 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Fip1l1Q9D824 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Fip1l1Q9D824 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Fip1l1Q9D824 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Fip1l1Q9D824 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Fip1l1Q9D824 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Fip1l1Q9D824 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Fip1l1Q9D824 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Fip1l1Q9D824 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Fip1l1Q9D824 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Fip1l1Q9D824 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Fip1l1Q9D824 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Fip1l1Q9D824 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Fip1l1Q9D824 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Fip1l1Q9D824 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Fip1l1Q9D824 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Fip1l1Q9D824 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Fip1l1Q9D824 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Fip1l1Q9D824 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Fip1l1Q9D824 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Fip1l1Q9D824 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Fip1l1Q9D824 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Fip1l1Q9D824 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Fip1l1Q9D824 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Fip1l1Q9D824 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Fip1l1Q9D824 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Fip1l1Q9D824 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Fip1l1Q9D824 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Fip1l1Q9D824 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Fip1l1Q9D824 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Fip1l1Q9D824 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Fip1l1Q9D824 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Fip1l1Q9D824 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Fip1l1Q9D824 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Fip1l1Q9D824 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Fip1l1Q9D824 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Fip1l1Q9D824 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Fip1l1Q9D824 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Fip1l1Q9D824 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Fip1l1Q9D824 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Fip1l1Q9D824 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Fip1l1Q9D824 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Fip1l1Q9D824 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Fip1l1Q9D824 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Fip1l1Q9D824 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Fip1l1Q9D824 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Fip1l1Q9D824 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Fip1l1Q9D824 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Fip1l1Q9D824 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Fip1l1Q9D824 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Fip1l1Q9D824 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fip1l1Q9D824 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fip1l1Q9D824 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fip1l1Q9D824 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fip1l1Q9D824 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fip1l1Q9D824 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fip1l1Q9D824 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fip1l1Q9D824 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fip1l1Q9D824 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fip1l1Q9D824 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fip1l1Q9D824 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Fip1l1Q9D824 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fip1l1Q9D824 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fip1l1Q9D824 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fip1l1Q9D824 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fip1l1Q9D824 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fip1l1Q9D824 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fip1l1Q9D824 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fip1l1Q9D824 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fip1l1Q9D824 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Fip1l1Q9D824 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fip1l1Q9D824 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fip1l1Q9D824 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fip1l1Q9D824 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms