Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7D7

Cldn23, Claudin-23, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn23Q9D7D7 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cldn23Q9D7D7 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cldn23Q9D7D7 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cldn23Q9D7D7 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cldn23Q9D7D7 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cldn23Q9D7D7 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cldn23Q9D7D7 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cldn23Q9D7D7 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cldn23Q9D7D7 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cldn23Q9D7D7 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cldn23Q9D7D7 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cldn23Q9D7D7 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cldn23Q9D7D7 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cldn23Q9D7D7 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cldn23Q9D7D7 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cldn23Q9D7D7 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cldn23Q9D7D7 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cldn23Q9D7D7 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cldn23Q9D7D7 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cldn23Q9D7D7 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cldn23Q9D7D7 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cldn23Q9D7D7 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cldn23Q9D7D7 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cldn23Q9D7D7 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cldn23Q9D7D7 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cldn23Q9D7D7 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cldn23Q9D7D7 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cldn23Q9D7D7 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cldn23Q9D7D7 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cldn23Q9D7D7 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cldn23Q9D7D7 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cldn23Q9D7D7 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cldn23Q9D7D7 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cldn23Q9D7D7 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cldn23Q9D7D7 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cldn23Q9D7D7 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cldn23Q9D7D7 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cldn23Q9D7D7 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cldn23Q9D7D7 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cldn23Q9D7D7 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cldn23Q9D7D7 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cldn23Q9D7D7 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cldn23Q9D7D7 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cldn23Q9D7D7 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cldn23Q9D7D7 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cldn23Q9D7D7 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cldn23Q9D7D7 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cldn23Q9D7D7 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cldn23Q9D7D7 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cldn23Q9D7D7 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cldn23Q9D7D7 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cldn23Q9D7D7 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cldn23Q9D7D7 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cldn23Q9D7D7 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cldn23Q9D7D7 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cldn23Q9D7D7 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Cldn23Q9D7D7 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Cldn23Q9D7D7 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Cldn23Q9D7D7 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cldn23Q9D7D7 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cldn23Q9D7D7 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cldn23Q9D7D7 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Cldn23Q9D7D7 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
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Cldn23Q9D7D7 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cldn23Q9D7D7 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cldn23Q9D7D7 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cldn23Q9D7D7 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cldn23Q9D7D7 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cldn23Q9D7D7 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cldn23Q9D7D7 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cldn23Q9D7D7 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cldn23Q9D7D7 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cldn23Q9D7D7 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cldn23Q9D7D7 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cldn23Q9D7D7 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cldn23Q9D7D7 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Cldn23Q9D7D7 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cldn23Q9D7D7 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cldn23Q9D7D7 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cldn23Q9D7D7 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cldn23Q9D7D7 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cldn23Q9D7D7 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cldn23Q9D7D7 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cldn23Q9D7D7 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cldn23Q9D7D7 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cldn23Q9D7D7 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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