Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6J3

Ccdc94, Coiled-coil domain-containing protein 94, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc94Q9D6J3 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc94Q9D6J3 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc94Q9D6J3 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc94Q9D6J3 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc94Q9D6J3 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc94Q9D6J3 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc94Q9D6J3 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc94Q9D6J3 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc94Q9D6J3 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc94Q9D6J3 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc94Q9D6J3 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc94Q9D6J3 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc94Q9D6J3 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc94Q9D6J3 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc94Q9D6J3 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc94Q9D6J3 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc94Q9D6J3 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc94Q9D6J3 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc94Q9D6J3 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc94Q9D6J3 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc94Q9D6J3 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc94Q9D6J3 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc94Q9D6J3 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc94Q9D6J3 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc94Q9D6J3 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc94Q9D6J3 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc94Q9D6J3 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc94Q9D6J3 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc94Q9D6J3 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc94Q9D6J3 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc94Q9D6J3 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc94Q9D6J3 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc94Q9D6J3 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc94Q9D6J3 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc94Q9D6J3 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc94Q9D6J3 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc94Q9D6J3 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc94Q9D6J3 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ccdc94Q9D6J3 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ccdc94Q9D6J3 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ccdc94Q9D6J3 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ccdc94Q9D6J3 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc94Q9D6J3 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc94Q9D6J3 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc94Q9D6J3 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc94Q9D6J3 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc94Q9D6J3 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc94Q9D6J3 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc94Q9D6J3 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc94Q9D6J3 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc94Q9D6J3 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc94Q9D6J3 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc94Q9D6J3 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc94Q9D6J3 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc94Q9D6J3 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc94Q9D6J3 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc94Q9D6J3 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc94Q9D6J3 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc94Q9D6J3 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc94Q9D6J3 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc94Q9D6J3 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc94Q9D6J3 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc94Q9D6J3 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc94Q9D6J3 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc94Q9D6J3 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc94Q9D6J3 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc94Q9D6J3 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc94Q9D6J3 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc94Q9D6J3 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc94Q9D6J3 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc94Q9D6J3 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc94Q9D6J3 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc94Q9D6J3 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc94Q9D6J3 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc94Q9D6J3 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc94Q9D6J3 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc94Q9D6J3 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc94Q9D6J3 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc94Q9D6J3 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc94Q9D6J3 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc94Q9D6J3 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc94Q9D6J3 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc94Q9D6J3 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc94Q9D6J3 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc94Q9D6J3 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc94Q9D6J3 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc94Q9D6J3 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc94Q9D6J3 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc94Q9D6J3 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc94Q9D6J3 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc94Q9D6J3 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc94Q9D6J3 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc94Q9D6J3 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc94Q9D6J3 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc94Q9D6J3 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc94Q9D6J3 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc94Q9D6J3 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc94Q9D6J3 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc94Q9D6J3 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc94Q9D6J3 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms