Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5U5

Pudp, Pseudouridine-5'-phosphatase, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PudpQ9D5U5 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PudpQ9D5U5 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PudpQ9D5U5 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PudpQ9D5U5 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PudpQ9D5U5 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PudpQ9D5U5 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PudpQ9D5U5 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PudpQ9D5U5 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PudpQ9D5U5 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PudpQ9D5U5 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PudpQ9D5U5 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PudpQ9D5U5 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PudpQ9D5U5 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PudpQ9D5U5 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PudpQ9D5U5 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PudpQ9D5U5 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PudpQ9D5U5 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PudpQ9D5U5 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PudpQ9D5U5 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PudpQ9D5U5 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PudpQ9D5U5 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
PudpQ9D5U5 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PudpQ9D5U5 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PudpQ9D5U5 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PudpQ9D5U5 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PudpQ9D5U5 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PudpQ9D5U5 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PudpQ9D5U5 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PudpQ9D5U5 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PudpQ9D5U5 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PudpQ9D5U5 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PudpQ9D5U5 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PudpQ9D5U5 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PudpQ9D5U5 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PudpQ9D5U5 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
PudpQ9D5U5 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
PudpQ9D5U5 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
PudpQ9D5U5 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
PudpQ9D5U5 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PudpQ9D5U5 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PudpQ9D5U5 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PudpQ9D5U5 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PudpQ9D5U5 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
PudpQ9D5U5 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PudpQ9D5U5 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PudpQ9D5U5 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PudpQ9D5U5 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PudpQ9D5U5 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PudpQ9D5U5 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PudpQ9D5U5 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
PudpQ9D5U5 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PudpQ9D5U5 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PudpQ9D5U5 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PudpQ9D5U5 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PudpQ9D5U5 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PudpQ9D5U5 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PudpQ9D5U5 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PudpQ9D5U5 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PudpQ9D5U5 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PudpQ9D5U5 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PudpQ9D5U5 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PudpQ9D5U5 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PudpQ9D5U5 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PudpQ9D5U5 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
PudpQ9D5U5 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PudpQ9D5U5 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PudpQ9D5U5 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PudpQ9D5U5 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PudpQ9D5U5 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PudpQ9D5U5 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PudpQ9D5U5 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
PudpQ9D5U5 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
PudpQ9D5U5 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
PudpQ9D5U5 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PudpQ9D5U5 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PudpQ9D5U5 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PudpQ9D5U5 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PudpQ9D5U5 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PudpQ9D5U5 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PudpQ9D5U5 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PudpQ9D5U5 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PudpQ9D5U5 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PudpQ9D5U5 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PudpQ9D5U5 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PudpQ9D5U5 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PudpQ9D5U5 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PudpQ9D5U5 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
PudpQ9D5U5 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PudpQ9D5U5 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PudpQ9D5U5 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PudpQ9D5U5 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
PudpQ9D5U5 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PudpQ9D5U5 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PudpQ9D5U5 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PudpQ9D5U5 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PudpQ9D5U5 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PudpQ9D5U5 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PudpQ9D5U5 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PudpQ9D5U5 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PudpQ9D5U5 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms