Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5L7

Spsb1, SPRY domain-containing SOCS box protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spsb1Q9D5L7 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Spsb1Q9D5L7 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Spsb1Q9D5L7 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Spsb1Q9D5L7 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Spsb1Q9D5L7 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Spsb1Q9D5L7 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Spsb1Q9D5L7 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Spsb1Q9D5L7 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Spsb1Q9D5L7 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Spsb1Q9D5L7 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Spsb1Q9D5L7 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Spsb1Q9D5L7 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Spsb1Q9D5L7 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Spsb1Q9D5L7 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Spsb1Q9D5L7 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Spsb1Q9D5L7 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Spsb1Q9D5L7 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Spsb1Q9D5L7 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Spsb1Q9D5L7 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Spsb1Q9D5L7 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Spsb1Q9D5L7 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Spsb1Q9D5L7 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Spsb1Q9D5L7 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Spsb1Q9D5L7 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Spsb1Q9D5L7 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Spsb1Q9D5L7 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Spsb1Q9D5L7 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Spsb1Q9D5L7 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Spsb1Q9D5L7 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Spsb1Q9D5L7 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Spsb1Q9D5L7 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Spsb1Q9D5L7 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Spsb1Q9D5L7 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Spsb1Q9D5L7 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Spsb1Q9D5L7 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Spsb1Q9D5L7 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Spsb1Q9D5L7 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Spsb1Q9D5L7 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Spsb1Q9D5L7 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Spsb1Q9D5L7 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Spsb1Q9D5L7 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Spsb1Q9D5L7 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Spsb1Q9D5L7 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Spsb1Q9D5L7 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Spsb1Q9D5L7 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Spsb1Q9D5L7 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Spsb1Q9D5L7 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Spsb1Q9D5L7 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Spsb1Q9D5L7 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Spsb1Q9D5L7 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Spsb1Q9D5L7 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Spsb1Q9D5L7 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Spsb1Q9D5L7 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Spsb1Q9D5L7 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Spsb1Q9D5L7 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Spsb1Q9D5L7 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Spsb1Q9D5L7 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Spsb1Q9D5L7 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Spsb1Q9D5L7 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Spsb1Q9D5L7 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Spsb1Q9D5L7 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Spsb1Q9D5L7 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Spsb1Q9D5L7 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Spsb1Q9D5L7 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Spsb1Q9D5L7 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Spsb1Q9D5L7 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Spsb1Q9D5L7 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Spsb1Q9D5L7 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Spsb1Q9D5L7 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Spsb1Q9D5L7 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Spsb1Q9D5L7 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Spsb1Q9D5L7 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Spsb1Q9D5L7 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Spsb1Q9D5L7 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Spsb1Q9D5L7 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Spsb1Q9D5L7 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Spsb1Q9D5L7 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Spsb1Q9D5L7 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Spsb1Q9D5L7 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Spsb1Q9D5L7 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Spsb1Q9D5L7 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Spsb1Q9D5L7 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Spsb1Q9D5L7 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Spsb1Q9D5L7 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Spsb1Q9D5L7 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Spsb1Q9D5L7 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Spsb1Q9D5L7 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Spsb1Q9D5L7 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Spsb1Q9D5L7 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Spsb1Q9D5L7 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Spsb1Q9D5L7 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Spsb1Q9D5L7 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Spsb1Q9D5L7 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Spsb1Q9D5L7 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Spsb1Q9D5L7 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Spsb1Q9D5L7 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Spsb1Q9D5L7 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Spsb1Q9D5L7 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Spsb1Q9D5L7 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Spsb1Q9D5L7 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms