Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5J6

Shpk, Sedoheptulokinase, mousemouse

Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ShpkQ9D5J6 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ShpkQ9D5J6 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ShpkQ9D5J6 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ShpkQ9D5J6 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ShpkQ9D5J6 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ShpkQ9D5J6 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ShpkQ9D5J6 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ShpkQ9D5J6 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ShpkQ9D5J6 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ShpkQ9D5J6 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ShpkQ9D5J6 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ShpkQ9D5J6 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ShpkQ9D5J6 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ShpkQ9D5J6 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ShpkQ9D5J6 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ShpkQ9D5J6 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ShpkQ9D5J6 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ShpkQ9D5J6 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ShpkQ9D5J6 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ShpkQ9D5J6 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ShpkQ9D5J6 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ShpkQ9D5J6 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ShpkQ9D5J6 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ShpkQ9D5J6 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ShpkQ9D5J6 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ShpkQ9D5J6 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ShpkQ9D5J6 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ShpkQ9D5J6 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ShpkQ9D5J6 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ShpkQ9D5J6 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ShpkQ9D5J6 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ShpkQ9D5J6 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ShpkQ9D5J6 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ShpkQ9D5J6 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ShpkQ9D5J6 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ShpkQ9D5J6 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ShpkQ9D5J6 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ShpkQ9D5J6 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ShpkQ9D5J6 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ShpkQ9D5J6 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ShpkQ9D5J6 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ShpkQ9D5J6 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ShpkQ9D5J6 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ShpkQ9D5J6 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ShpkQ9D5J6 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ShpkQ9D5J6 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ShpkQ9D5J6 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ShpkQ9D5J6 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ShpkQ9D5J6 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ShpkQ9D5J6 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ShpkQ9D5J6 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ShpkQ9D5J6 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ShpkQ9D5J6 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ShpkQ9D5J6 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ShpkQ9D5J6 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ShpkQ9D5J6 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ShpkQ9D5J6 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ShpkQ9D5J6 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ShpkQ9D5J6 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ShpkQ9D5J6 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ShpkQ9D5J6 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ShpkQ9D5J6 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
ShpkQ9D5J6 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
ShpkQ9D5J6 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ShpkQ9D5J6 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ShpkQ9D5J6 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ShpkQ9D5J6 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ShpkQ9D5J6 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ShpkQ9D5J6 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ShpkQ9D5J6 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ShpkQ9D5J6 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ShpkQ9D5J6 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ShpkQ9D5J6 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ShpkQ9D5J6 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ShpkQ9D5J6 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ShpkQ9D5J6 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ShpkQ9D5J6 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ShpkQ9D5J6 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ShpkQ9D5J6 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ShpkQ9D5J6 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ShpkQ9D5J6 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ShpkQ9D5J6 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ShpkQ9D5J6 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ShpkQ9D5J6 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
ShpkQ9D5J6 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ShpkQ9D5J6 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ShpkQ9D5J6 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ShpkQ9D5J6 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ShpkQ9D5J6 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ShpkQ9D5J6 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ShpkQ9D5J6 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ShpkQ9D5J6 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ShpkQ9D5J6 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ShpkQ9D5J6 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ShpkQ9D5J6 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ShpkQ9D5J6 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ShpkQ9D5J6 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ShpkQ9D5J6 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ShpkQ9D5J6 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ShpkQ9D5J6 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms