Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4H7

Lonrf3, LON peptidase N-terminal domain and RING finger protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lonrf3Q9D4H7 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lonrf3Q9D4H7 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lonrf3Q9D4H7 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lonrf3Q9D4H7 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lonrf3Q9D4H7 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lonrf3Q9D4H7 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lonrf3Q9D4H7 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lonrf3Q9D4H7 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lonrf3Q9D4H7 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lonrf3Q9D4H7 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lonrf3Q9D4H7 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lonrf3Q9D4H7 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Lonrf3Q9D4H7 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Lonrf3Q9D4H7 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lonrf3Q9D4H7 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lonrf3Q9D4H7 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lonrf3Q9D4H7 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lonrf3Q9D4H7 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lonrf3Q9D4H7 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lonrf3Q9D4H7 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lonrf3Q9D4H7 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Lonrf3Q9D4H7 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Lonrf3Q9D4H7 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Lonrf3Q9D4H7 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Lonrf3Q9D4H7 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Lonrf3Q9D4H7 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Lonrf3Q9D4H7 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Lonrf3Q9D4H7 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Lonrf3Q9D4H7 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Lonrf3Q9D4H7 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Lonrf3Q9D4H7 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Lonrf3Q9D4H7 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Lonrf3Q9D4H7 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Lonrf3Q9D4H7 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Lonrf3Q9D4H7 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Lonrf3Q9D4H7 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Lonrf3Q9D4H7 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Lonrf3Q9D4H7 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Lonrf3Q9D4H7 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Lonrf3Q9D4H7 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Lonrf3Q9D4H7 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Lonrf3Q9D4H7 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Lonrf3Q9D4H7 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Lonrf3Q9D4H7 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Lonrf3Q9D4H7 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Lonrf3Q9D4H7 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Lonrf3Q9D4H7 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Lonrf3Q9D4H7 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Lonrf3Q9D4H7 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Lonrf3Q9D4H7 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Lonrf3Q9D4H7 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Lonrf3Q9D4H7 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Lonrf3Q9D4H7 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Lonrf3Q9D4H7 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Lonrf3Q9D4H7 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Lonrf3Q9D4H7 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Lonrf3Q9D4H7 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Lonrf3Q9D4H7 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Lonrf3Q9D4H7 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Lonrf3Q9D4H7 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Lonrf3Q9D4H7 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Lonrf3Q9D4H7 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Lonrf3Q9D4H7 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Lonrf3Q9D4H7 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Lonrf3Q9D4H7 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Lonrf3Q9D4H7 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Lonrf3Q9D4H7 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Lonrf3Q9D4H7 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Lonrf3Q9D4H7 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Lonrf3Q9D4H7 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Lonrf3Q9D4H7 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Lonrf3Q9D4H7 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Lonrf3Q9D4H7 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Lonrf3Q9D4H7 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Lonrf3Q9D4H7 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Lonrf3Q9D4H7 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Lonrf3Q9D4H7 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Lonrf3Q9D4H7 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Lonrf3Q9D4H7 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Lonrf3Q9D4H7 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Lonrf3Q9D4H7 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Lonrf3Q9D4H7 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Lonrf3Q9D4H7 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Lonrf3Q9D4H7 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Lonrf3Q9D4H7 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Lonrf3Q9D4H7 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Lonrf3Q9D4H7 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Lonrf3Q9D4H7 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Lonrf3Q9D4H7 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Lonrf3Q9D4H7 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lonrf3Q9D4H7 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lonrf3Q9D4H7 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lonrf3Q9D4H7 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lonrf3Q9D4H7 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lonrf3Q9D4H7 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Lonrf3Q9D4H7 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lonrf3Q9D4H7 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lonrf3Q9D4H7 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lonrf3Q9D4H7 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lonrf3Q9D4H7 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms