Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4F3

Fam90a1b, Family with sequence similarity 90, member A1B, mousemouse

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam90a1bQ9D4F3 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Fam90a1bQ9D4F3 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Fam90a1bQ9D4F3 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Fam90a1bQ9D4F3 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Fam90a1bQ9D4F3 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Fam90a1bQ9D4F3 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Fam90a1bQ9D4F3 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Fam90a1bQ9D4F3 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Fam90a1bQ9D4F3 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Fam90a1bQ9D4F3 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Fam90a1bQ9D4F3 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Fam90a1bQ9D4F3 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Fam90a1bQ9D4F3 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Fam90a1bQ9D4F3 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Fam90a1bQ9D4F3 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Fam90a1bQ9D4F3 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Fam90a1bQ9D4F3 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Fam90a1bQ9D4F3 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Fam90a1bQ9D4F3 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Fam90a1bQ9D4F3 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Fam90a1bQ9D4F3 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Fam90a1bQ9D4F3 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Fam90a1bQ9D4F3 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Fam90a1bQ9D4F3 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Fam90a1bQ9D4F3 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Fam90a1bQ9D4F3 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Fam90a1bQ9D4F3 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Fam90a1bQ9D4F3 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Fam90a1bQ9D4F3 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Fam90a1bQ9D4F3 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Fam90a1bQ9D4F3 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Fam90a1bQ9D4F3 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Fam90a1bQ9D4F3 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Fam90a1bQ9D4F3 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Fam90a1bQ9D4F3 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Fam90a1bQ9D4F3 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Fam90a1bQ9D4F3 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Fam90a1bQ9D4F3 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Fam90a1bQ9D4F3 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Fam90a1bQ9D4F3 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Fam90a1bQ9D4F3 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Fam90a1bQ9D4F3 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Fam90a1bQ9D4F3 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Fam90a1bQ9D4F3 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Fam90a1bQ9D4F3 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Fam90a1bQ9D4F3 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Fam90a1bQ9D4F3 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Fam90a1bQ9D4F3 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Fam90a1bQ9D4F3 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Fam90a1bQ9D4F3 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Fam90a1bQ9D4F3 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Fam90a1bQ9D4F3 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Fam90a1bQ9D4F3 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Fam90a1bQ9D4F3 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Fam90a1bQ9D4F3 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Fam90a1bQ9D4F3 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Fam90a1bQ9D4F3 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Fam90a1bQ9D4F3 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Fam90a1bQ9D4F3 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Fam90a1bQ9D4F3 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Fam90a1bQ9D4F3 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Fam90a1bQ9D4F3 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Fam90a1bQ9D4F3 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Fam90a1bQ9D4F3 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Fam90a1bQ9D4F3 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Fam90a1bQ9D4F3 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Fam90a1bQ9D4F3 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Fam90a1bQ9D4F3 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Fam90a1bQ9D4F3 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Fam90a1bQ9D4F3 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Fam90a1bQ9D4F3 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Fam90a1bQ9D4F3 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Fam90a1bQ9D4F3 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Fam90a1bQ9D4F3 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Fam90a1bQ9D4F3 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Fam90a1bQ9D4F3 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Fam90a1bQ9D4F3 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Fam90a1bQ9D4F3 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Fam90a1bQ9D4F3 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Fam90a1bQ9D4F3 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Fam90a1bQ9D4F3 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Fam90a1bQ9D4F3 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Fam90a1bQ9D4F3 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Fam90a1bQ9D4F3 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Fam90a1bQ9D4F3 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Fam90a1bQ9D4F3 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Fam90a1bQ9D4F3 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Fam90a1bQ9D4F3 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Fam90a1bQ9D4F3 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Fam90a1bQ9D4F3 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Fam90a1bQ9D4F3 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Fam90a1bQ9D4F3 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Fam90a1bQ9D4F3 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Fam90a1bQ9D4F3 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Fam90a1bQ9D4F3 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Fam90a1bQ9D4F3 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Fam90a1bQ9D4F3 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Fam90a1bQ9D4F3 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Fam90a1bQ9D4F3 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Fam90a1bQ9D4F3 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms