Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4C9

Clvs1, Clavesin-1, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clvs1Q9D4C9 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Clvs1Q9D4C9 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Clvs1Q9D4C9 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Clvs1Q9D4C9 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Clvs1Q9D4C9 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Clvs1Q9D4C9 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Clvs1Q9D4C9 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Clvs1Q9D4C9 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
Clvs1Q9D4C9 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Clvs1Q9D4C9 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Clvs1Q9D4C9 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Clvs1Q9D4C9 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Clvs1Q9D4C9 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Clvs1Q9D4C9 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Clvs1Q9D4C9 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Clvs1Q9D4C9 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Clvs1Q9D4C9 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Clvs1Q9D4C9 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Clvs1Q9D4C9 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Clvs1Q9D4C9 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Clvs1Q9D4C9 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Clvs1Q9D4C9 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Clvs1Q9D4C9 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Clvs1Q9D4C9 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Clvs1Q9D4C9 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Clvs1Q9D4C9 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Clvs1Q9D4C9 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Clvs1Q9D4C9 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Clvs1Q9D4C9 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Clvs1Q9D4C9 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Clvs1Q9D4C9 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Clvs1Q9D4C9 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Clvs1Q9D4C9 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Clvs1Q9D4C9 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Clvs1Q9D4C9 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Clvs1Q9D4C9 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Clvs1Q9D4C9 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Clvs1Q9D4C9 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Clvs1Q9D4C9 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Clvs1Q9D4C9 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Clvs1Q9D4C9 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Clvs1Q9D4C9 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Clvs1Q9D4C9 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Clvs1Q9D4C9 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Clvs1Q9D4C9 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Clvs1Q9D4C9 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Clvs1Q9D4C9 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Clvs1Q9D4C9 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Clvs1Q9D4C9 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Clvs1Q9D4C9 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Clvs1Q9D4C9 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Clvs1Q9D4C9 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Clvs1Q9D4C9 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Clvs1Q9D4C9 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Clvs1Q9D4C9 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Clvs1Q9D4C9 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Clvs1Q9D4C9 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Clvs1Q9D4C9 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Clvs1Q9D4C9 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Clvs1Q9D4C9 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Clvs1Q9D4C9 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Clvs1Q9D4C9 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Clvs1Q9D4C9 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Clvs1Q9D4C9 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Clvs1Q9D4C9 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Clvs1Q9D4C9 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Clvs1Q9D4C9 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Clvs1Q9D4C9 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Clvs1Q9D4C9 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Clvs1Q9D4C9 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Clvs1Q9D4C9 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Clvs1Q9D4C9 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Clvs1Q9D4C9 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Clvs1Q9D4C9 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Clvs1Q9D4C9 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Clvs1Q9D4C9 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Clvs1Q9D4C9 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Clvs1Q9D4C9 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Clvs1Q9D4C9 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Clvs1Q9D4C9 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Clvs1Q9D4C9 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Clvs1Q9D4C9 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Clvs1Q9D4C9 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Clvs1Q9D4C9 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Clvs1Q9D4C9 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Clvs1Q9D4C9 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Clvs1Q9D4C9 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Clvs1Q9D4C9 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Clvs1Q9D4C9 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Clvs1Q9D4C9 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Clvs1Q9D4C9 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Clvs1Q9D4C9 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Clvs1Q9D4C9 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Clvs1Q9D4C9 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Clvs1Q9D4C9 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Clvs1Q9D4C9 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Clvs1Q9D4C9 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Clvs1Q9D4C9 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Clvs1Q9D4C9 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Clvs1Q9D4C9 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms