Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4C6

Lrp2bp, LRP2-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrp2bpQ9D4C6 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Lrp2bpQ9D4C6 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Lrp2bpQ9D4C6 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Lrp2bpQ9D4C6 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Lrp2bpQ9D4C6 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Lrp2bpQ9D4C6 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Lrp2bpQ9D4C6 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Lrp2bpQ9D4C6 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Lrp2bpQ9D4C6 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Lrp2bpQ9D4C6 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Lrp2bpQ9D4C6 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Lrp2bpQ9D4C6 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Lrp2bpQ9D4C6 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Lrp2bpQ9D4C6 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Lrp2bpQ9D4C6 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Lrp2bpQ9D4C6 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Lrp2bpQ9D4C6 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Lrp2bpQ9D4C6 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Lrp2bpQ9D4C6 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Lrp2bpQ9D4C6 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Lrp2bpQ9D4C6 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Lrp2bpQ9D4C6 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Lrp2bpQ9D4C6 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Lrp2bpQ9D4C6 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Lrp2bpQ9D4C6 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Lrp2bpQ9D4C6 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Lrp2bpQ9D4C6 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Lrp2bpQ9D4C6 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Lrp2bpQ9D4C6 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Lrp2bpQ9D4C6 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Lrp2bpQ9D4C6 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Lrp2bpQ9D4C6 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Lrp2bpQ9D4C6 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Lrp2bpQ9D4C6 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Lrp2bpQ9D4C6 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Lrp2bpQ9D4C6 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Lrp2bpQ9D4C6 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Lrp2bpQ9D4C6 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Lrp2bpQ9D4C6 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Lrp2bpQ9D4C6 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Lrp2bpQ9D4C6 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Lrp2bpQ9D4C6 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Lrp2bpQ9D4C6 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Lrp2bpQ9D4C6 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Lrp2bpQ9D4C6 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Lrp2bpQ9D4C6 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Lrp2bpQ9D4C6 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Lrp2bpQ9D4C6 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Lrp2bpQ9D4C6 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Lrp2bpQ9D4C6 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Lrp2bpQ9D4C6 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Lrp2bpQ9D4C6 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Lrp2bpQ9D4C6 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Lrp2bpQ9D4C6 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Lrp2bpQ9D4C6 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lrp2bpQ9D4C6 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lrp2bpQ9D4C6 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lrp2bpQ9D4C6 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lrp2bpQ9D4C6 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lrp2bpQ9D4C6 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lrp2bpQ9D4C6 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lrp2bpQ9D4C6 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lrp2bpQ9D4C6 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lrp2bpQ9D4C6 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lrp2bpQ9D4C6 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lrp2bpQ9D4C6 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lrp2bpQ9D4C6 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lrp2bpQ9D4C6 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lrp2bpQ9D4C6 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lrp2bpQ9D4C6 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lrp2bpQ9D4C6 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lrp2bpQ9D4C6 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lrp2bpQ9D4C6 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.83
Lrp2bpQ9D4C6 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Lrp2bpQ9D4C6 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lrp2bpQ9D4C6 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lrp2bpQ9D4C6 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lrp2bpQ9D4C6 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lrp2bpQ9D4C6 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lrp2bpQ9D4C6 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lrp2bpQ9D4C6 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lrp2bpQ9D4C6 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lrp2bpQ9D4C6 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lrp2bpQ9D4C6 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lrp2bpQ9D4C6 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lrp2bpQ9D4C6 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lrp2bpQ9D4C6 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lrp2bpQ9D4C6 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lrp2bpQ9D4C6 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lrp2bpQ9D4C6 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lrp2bpQ9D4C6 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lrp2bpQ9D4C6 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Lrp2bpQ9D4C6 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lrp2bpQ9D4C6 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lrp2bpQ9D4C6 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lrp2bpQ9D4C6 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lrp2bpQ9D4C6 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lrp2bpQ9D4C6 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lrp2bpQ9D4C6 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lrp2bpQ9D4C6 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms