Protein–RNA interactions for Protein: Q9D495

Syce1, Synaptonemal complex central element protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syce1Q9D495 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Syce1Q9D495 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Syce1Q9D495 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Syce1Q9D495 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Syce1Q9D495 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Syce1Q9D495 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Syce1Q9D495 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Syce1Q9D495 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Syce1Q9D495 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Syce1Q9D495 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Syce1Q9D495 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Syce1Q9D495 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Syce1Q9D495 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Syce1Q9D495 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Syce1Q9D495 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Syce1Q9D495 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Syce1Q9D495 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Syce1Q9D495 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Syce1Q9D495 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Syce1Q9D495 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Syce1Q9D495 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Syce1Q9D495 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Syce1Q9D495 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Syce1Q9D495 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Syce1Q9D495 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Syce1Q9D495 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Syce1Q9D495 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Syce1Q9D495 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Syce1Q9D495 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Syce1Q9D495 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Syce1Q9D495 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Syce1Q9D495 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Syce1Q9D495 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Syce1Q9D495 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Syce1Q9D495 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Syce1Q9D495 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Syce1Q9D495 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Syce1Q9D495 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Syce1Q9D495 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Syce1Q9D495 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Syce1Q9D495 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Syce1Q9D495 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Syce1Q9D495 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Syce1Q9D495 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Syce1Q9D495 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Syce1Q9D495 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Syce1Q9D495 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Syce1Q9D495 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Syce1Q9D495 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Syce1Q9D495 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Syce1Q9D495 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Syce1Q9D495 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Syce1Q9D495 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Syce1Q9D495 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Syce1Q9D495 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Syce1Q9D495 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Syce1Q9D495 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Syce1Q9D495 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Syce1Q9D495 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Syce1Q9D495 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Syce1Q9D495 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Syce1Q9D495 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Syce1Q9D495 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Syce1Q9D495 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Syce1Q9D495 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Syce1Q9D495 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Syce1Q9D495 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Syce1Q9D495 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Syce1Q9D495 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Syce1Q9D495 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Syce1Q9D495 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Syce1Q9D495 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Syce1Q9D495 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Syce1Q9D495 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Syce1Q9D495 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Syce1Q9D495 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Syce1Q9D495 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Syce1Q9D495 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Syce1Q9D495 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Syce1Q9D495 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Syce1Q9D495 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Syce1Q9D495 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Syce1Q9D495 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Syce1Q9D495 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Syce1Q9D495 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Syce1Q9D495 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Syce1Q9D495 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Syce1Q9D495 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Syce1Q9D495 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Syce1Q9D495 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Syce1Q9D495 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Syce1Q9D495 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Syce1Q9D495 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Syce1Q9D495 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Syce1Q9D495 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Syce1Q9D495 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Syce1Q9D495 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Syce1Q9D495 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Syce1Q9D495 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Syce1Q9D495 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms