Protein–RNA interactions for Protein: Q9D439

Cfap53, Cilia- and flagella-associated protein 53, mousemouse

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Length 514 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap53Q9D439 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cfap53Q9D439 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cfap53Q9D439 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cfap53Q9D439 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cfap53Q9D439 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cfap53Q9D439 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cfap53Q9D439 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cfap53Q9D439 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cfap53Q9D439 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Cfap53Q9D439 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cfap53Q9D439 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cfap53Q9D439 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cfap53Q9D439 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cfap53Q9D439 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cfap53Q9D439 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cfap53Q9D439 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cfap53Q9D439 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cfap53Q9D439 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cfap53Q9D439 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Cfap53Q9D439 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cfap53Q9D439 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cfap53Q9D439 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cfap53Q9D439 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cfap53Q9D439 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cfap53Q9D439 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cfap53Q9D439 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cfap53Q9D439 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cfap53Q9D439 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cfap53Q9D439 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cfap53Q9D439 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cfap53Q9D439 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Cfap53Q9D439 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cfap53Q9D439 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cfap53Q9D439 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cfap53Q9D439 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cfap53Q9D439 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cfap53Q9D439 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
Cfap53Q9D439 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cfap53Q9D439 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cfap53Q9D439 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cfap53Q9D439 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cfap53Q9D439 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cfap53Q9D439 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cfap53Q9D439 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cfap53Q9D439 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cfap53Q9D439 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cfap53Q9D439 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cfap53Q9D439 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cfap53Q9D439 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cfap53Q9D439 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cfap53Q9D439 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cfap53Q9D439 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cfap53Q9D439 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cfap53Q9D439 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cfap53Q9D439 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cfap53Q9D439 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cfap53Q9D439 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cfap53Q9D439 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cfap53Q9D439 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cfap53Q9D439 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cfap53Q9D439 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cfap53Q9D439 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cfap53Q9D439 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cfap53Q9D439 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cfap53Q9D439 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cfap53Q9D439 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cfap53Q9D439 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cfap53Q9D439 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cfap53Q9D439 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cfap53Q9D439 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cfap53Q9D439 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cfap53Q9D439 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cfap53Q9D439 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cfap53Q9D439 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cfap53Q9D439 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cfap53Q9D439 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cfap53Q9D439 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cfap53Q9D439 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cfap53Q9D439 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cfap53Q9D439 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cfap53Q9D439 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cfap53Q9D439 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cfap53Q9D439 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cfap53Q9D439 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Cfap53Q9D439 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cfap53Q9D439 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cfap53Q9D439 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cfap53Q9D439 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cfap53Q9D439 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cfap53Q9D439 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cfap53Q9D439 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cfap53Q9D439 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cfap53Q9D439 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cfap53Q9D439 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cfap53Q9D439 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cfap53Q9D439 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cfap53Q9D439 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cfap53Q9D439 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cfap53Q9D439 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cfap53Q9D439 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
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