Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2C9

Snapc3, snRNA-activating protein complex subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snapc3Q9D2C9 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
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Snapc3Q9D2C9 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Snapc3Q9D2C9 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
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Snapc3Q9D2C9 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snapc3Q9D2C9 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
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Snapc3Q9D2C9 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
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Snapc3Q9D2C9 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Snapc3Q9D2C9 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
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Snapc3Q9D2C9 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Snapc3Q9D2C9 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Snapc3Q9D2C9 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Snapc3Q9D2C9 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Snapc3Q9D2C9 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Snapc3Q9D2C9 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
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Snapc3Q9D2C9 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
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Snapc3Q9D2C9 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
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Snapc3Q9D2C9 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snapc3Q9D2C9 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snapc3Q9D2C9 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snapc3Q9D2C9 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
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Snapc3Q9D2C9 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snapc3Q9D2C9 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snapc3Q9D2C9 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snapc3Q9D2C9 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
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Snapc3Q9D2C9 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
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Snapc3Q9D2C9 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
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Snapc3Q9D2C9 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
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Snapc3Q9D2C9 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snapc3Q9D2C9 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snapc3Q9D2C9 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
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Snapc3Q9D2C9 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snapc3Q9D2C9 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snapc3Q9D2C9 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snapc3Q9D2C9 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snapc3Q9D2C9 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snapc3Q9D2C9 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snapc3Q9D2C9 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snapc3Q9D2C9 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snapc3Q9D2C9 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snapc3Q9D2C9 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snapc3Q9D2C9 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snapc3Q9D2C9 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snapc3Q9D2C9 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snapc3Q9D2C9 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snapc3Q9D2C9 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snapc3Q9D2C9 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snapc3Q9D2C9 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snapc3Q9D2C9 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snapc3Q9D2C9 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
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Snapc3Q9D2C9 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
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