Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1K7

UPF0687 protein C20orf27 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 174 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D1K7 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9D1K7 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9D1K7 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9D1K7 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9D1K7 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9D1K7 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9D1K7 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9D1K7 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9D1K7 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9D1K7 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9D1K7 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9D1K7 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9D1K7 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q9D1K7 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q9D1K7 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q9D1K7 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q9D1K7 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Q9D1K7 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q9D1K7 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q9D1K7 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Q9D1K7 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Q9D1K7 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q9D1K7 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q9D1K7 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q9D1K7 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Q9D1K7 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Q9D1K7 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Q9D1K7 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Q9D1K7 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Q9D1K7 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Q9D1K7 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Q9D1K7 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q9D1K7 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q9D1K7 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q9D1K7 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q9D1K7 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q9D1K7 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q9D1K7 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q9D1K7 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q9D1K7 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q9D1K7 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q9D1K7 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q9D1K7 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q9D1K7 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q9D1K7 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q9D1K7 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q9D1K7 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q9D1K7 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q9D1K7 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q9D1K7 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q9D1K7 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q9D1K7 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q9D1K7 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q9D1K7 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q9D1K7 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q9D1K7 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q9D1K7 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q9D1K7 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q9D1K7 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q9D1K7 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q9D1K7 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q9D1K7 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q9D1K7 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q9D1K7 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q9D1K7 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q9D1K7 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q9D1K7 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Q9D1K7 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q9D1K7 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Q9D1K7 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q9D1K7 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q9D1K7 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q9D1K7 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q9D1K7 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q9D1K7 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q9D1K7 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q9D1K7 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q9D1K7 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q9D1K7 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q9D1K7 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q9D1K7 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q9D1K7 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q9D1K7 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q9D1K7 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q9D1K7 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q9D1K7 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q9D1K7 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q9D1K7 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q9D1K7 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q9D1K7 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Q9D1K7 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q9D1K7 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q9D1K7 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q9D1K7 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q9D1K7 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q9D1K7 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q9D1K7 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q9D1K7 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q9D1K7 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q9D1K7 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms