Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1F0

Rtl8b, CAAX box 1 homolog A (Human), mousemouse

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtl8bQ9D1F0 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rtl8bQ9D1F0 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rtl8bQ9D1F0 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rtl8bQ9D1F0 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rtl8bQ9D1F0 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Rtl8bQ9D1F0 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Rtl8bQ9D1F0 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rtl8bQ9D1F0 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rtl8bQ9D1F0 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rtl8bQ9D1F0 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rtl8bQ9D1F0 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rtl8bQ9D1F0 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rtl8bQ9D1F0 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rtl8bQ9D1F0 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rtl8bQ9D1F0 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rtl8bQ9D1F0 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rtl8bQ9D1F0 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rtl8bQ9D1F0 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rtl8bQ9D1F0 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rtl8bQ9D1F0 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rtl8bQ9D1F0 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rtl8bQ9D1F0 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rtl8bQ9D1F0 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Rtl8bQ9D1F0 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rtl8bQ9D1F0 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rtl8bQ9D1F0 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rtl8bQ9D1F0 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rtl8bQ9D1F0 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rtl8bQ9D1F0 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rtl8bQ9D1F0 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rtl8bQ9D1F0 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rtl8bQ9D1F0 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rtl8bQ9D1F0 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rtl8bQ9D1F0 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rtl8bQ9D1F0 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rtl8bQ9D1F0 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rtl8bQ9D1F0 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rtl8bQ9D1F0 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rtl8bQ9D1F0 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rtl8bQ9D1F0 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rtl8bQ9D1F0 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rtl8bQ9D1F0 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rtl8bQ9D1F0 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rtl8bQ9D1F0 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rtl8bQ9D1F0 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rtl8bQ9D1F0 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rtl8bQ9D1F0 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rtl8bQ9D1F0 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rtl8bQ9D1F0 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rtl8bQ9D1F0 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rtl8bQ9D1F0 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rtl8bQ9D1F0 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rtl8bQ9D1F0 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rtl8bQ9D1F0 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rtl8bQ9D1F0 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rtl8bQ9D1F0 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rtl8bQ9D1F0 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rtl8bQ9D1F0 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rtl8bQ9D1F0 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rtl8bQ9D1F0 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rtl8bQ9D1F0 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rtl8bQ9D1F0 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rtl8bQ9D1F0 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rtl8bQ9D1F0 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rtl8bQ9D1F0 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rtl8bQ9D1F0 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Rtl8bQ9D1F0 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rtl8bQ9D1F0 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rtl8bQ9D1F0 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rtl8bQ9D1F0 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rtl8bQ9D1F0 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rtl8bQ9D1F0 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rtl8bQ9D1F0 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rtl8bQ9D1F0 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rtl8bQ9D1F0 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rtl8bQ9D1F0 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rtl8bQ9D1F0 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rtl8bQ9D1F0 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rtl8bQ9D1F0 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rtl8bQ9D1F0 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rtl8bQ9D1F0 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rtl8bQ9D1F0 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rtl8bQ9D1F0 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rtl8bQ9D1F0 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rtl8bQ9D1F0 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Rtl8bQ9D1F0 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rtl8bQ9D1F0 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rtl8bQ9D1F0 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rtl8bQ9D1F0 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rtl8bQ9D1F0 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rtl8bQ9D1F0 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rtl8bQ9D1F0 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rtl8bQ9D1F0 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rtl8bQ9D1F0 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rtl8bQ9D1F0 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rtl8bQ9D1F0 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rtl8bQ9D1F0 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rtl8bQ9D1F0 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rtl8bQ9D1F0 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rtl8bQ9D1F0 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms