Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1E5

Lmbr1l, Protein LMBR1L, mousemouse

Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmbr1lQ9D1E5 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lmbr1lQ9D1E5 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lmbr1lQ9D1E5 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lmbr1lQ9D1E5 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lmbr1lQ9D1E5 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lmbr1lQ9D1E5 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lmbr1lQ9D1E5 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lmbr1lQ9D1E5 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lmbr1lQ9D1E5 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lmbr1lQ9D1E5 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Lmbr1lQ9D1E5 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lmbr1lQ9D1E5 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Lmbr1lQ9D1E5 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lmbr1lQ9D1E5 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lmbr1lQ9D1E5 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lmbr1lQ9D1E5 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lmbr1lQ9D1E5 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lmbr1lQ9D1E5 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lmbr1lQ9D1E5 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lmbr1lQ9D1E5 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lmbr1lQ9D1E5 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lmbr1lQ9D1E5 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lmbr1lQ9D1E5 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lmbr1lQ9D1E5 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lmbr1lQ9D1E5 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Lmbr1lQ9D1E5 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lmbr1lQ9D1E5 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lmbr1lQ9D1E5 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lmbr1lQ9D1E5 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lmbr1lQ9D1E5 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lmbr1lQ9D1E5 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lmbr1lQ9D1E5 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lmbr1lQ9D1E5 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lmbr1lQ9D1E5 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lmbr1lQ9D1E5 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lmbr1lQ9D1E5 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lmbr1lQ9D1E5 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lmbr1lQ9D1E5 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lmbr1lQ9D1E5 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lmbr1lQ9D1E5 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lmbr1lQ9D1E5 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lmbr1lQ9D1E5 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lmbr1lQ9D1E5 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lmbr1lQ9D1E5 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lmbr1lQ9D1E5 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lmbr1lQ9D1E5 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lmbr1lQ9D1E5 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lmbr1lQ9D1E5 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Lmbr1lQ9D1E5 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Lmbr1lQ9D1E5 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Lmbr1lQ9D1E5 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Lmbr1lQ9D1E5 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Lmbr1lQ9D1E5 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Lmbr1lQ9D1E5 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Lmbr1lQ9D1E5 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Lmbr1lQ9D1E5 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Lmbr1lQ9D1E5 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Lmbr1lQ9D1E5 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Lmbr1lQ9D1E5 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Lmbr1lQ9D1E5 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Lmbr1lQ9D1E5 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Lmbr1lQ9D1E5 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lmbr1lQ9D1E5 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lmbr1lQ9D1E5 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lmbr1lQ9D1E5 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lmbr1lQ9D1E5 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lmbr1lQ9D1E5 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lmbr1lQ9D1E5 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Lmbr1lQ9D1E5 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Lmbr1lQ9D1E5 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lmbr1lQ9D1E5 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lmbr1lQ9D1E5 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lmbr1lQ9D1E5 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lmbr1lQ9D1E5 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lmbr1lQ9D1E5 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lmbr1lQ9D1E5 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lmbr1lQ9D1E5 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lmbr1lQ9D1E5 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lmbr1lQ9D1E5 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lmbr1lQ9D1E5 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lmbr1lQ9D1E5 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lmbr1lQ9D1E5 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lmbr1lQ9D1E5 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lmbr1lQ9D1E5 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lmbr1lQ9D1E5 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Lmbr1lQ9D1E5 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lmbr1lQ9D1E5 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lmbr1lQ9D1E5 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lmbr1lQ9D1E5 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lmbr1lQ9D1E5 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lmbr1lQ9D1E5 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lmbr1lQ9D1E5 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lmbr1lQ9D1E5 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lmbr1lQ9D1E5 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lmbr1lQ9D1E5 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lmbr1lQ9D1E5 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lmbr1lQ9D1E5 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Lmbr1lQ9D1E5 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lmbr1lQ9D1E5 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lmbr1lQ9D1E5 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms