Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1B9

Mrpl28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl28Q9D1B9 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mrpl28Q9D1B9 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Mrpl28Q9D1B9 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Mrpl28Q9D1B9 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Mrpl28Q9D1B9 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mrpl28Q9D1B9 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mrpl28Q9D1B9 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mrpl28Q9D1B9 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mrpl28Q9D1B9 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mrpl28Q9D1B9 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mrpl28Q9D1B9 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Mrpl28Q9D1B9 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mrpl28Q9D1B9 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mrpl28Q9D1B9 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mrpl28Q9D1B9 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mrpl28Q9D1B9 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mrpl28Q9D1B9 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Mrpl28Q9D1B9 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mrpl28Q9D1B9 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mrpl28Q9D1B9 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mrpl28Q9D1B9 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mrpl28Q9D1B9 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Mrpl28Q9D1B9 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mrpl28Q9D1B9 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mrpl28Q9D1B9 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mrpl28Q9D1B9 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mrpl28Q9D1B9 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mrpl28Q9D1B9 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mrpl28Q9D1B9 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mrpl28Q9D1B9 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mrpl28Q9D1B9 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mrpl28Q9D1B9 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mrpl28Q9D1B9 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mrpl28Q9D1B9 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mrpl28Q9D1B9 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mrpl28Q9D1B9 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mrpl28Q9D1B9 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mrpl28Q9D1B9 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mrpl28Q9D1B9 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mrpl28Q9D1B9 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mrpl28Q9D1B9 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mrpl28Q9D1B9 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mrpl28Q9D1B9 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mrpl28Q9D1B9 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mrpl28Q9D1B9 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mrpl28Q9D1B9 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Mrpl28Q9D1B9 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Mrpl28Q9D1B9 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mrpl28Q9D1B9 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mrpl28Q9D1B9 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mrpl28Q9D1B9 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mrpl28Q9D1B9 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mrpl28Q9D1B9 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mrpl28Q9D1B9 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Mrpl28Q9D1B9 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mrpl28Q9D1B9 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mrpl28Q9D1B9 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mrpl28Q9D1B9 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mrpl28Q9D1B9 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Mrpl28Q9D1B9 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mrpl28Q9D1B9 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mrpl28Q9D1B9 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mrpl28Q9D1B9 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mrpl28Q9D1B9 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mrpl28Q9D1B9 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mrpl28Q9D1B9 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mrpl28Q9D1B9 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mrpl28Q9D1B9 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mrpl28Q9D1B9 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mrpl28Q9D1B9 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mrpl28Q9D1B9 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mrpl28Q9D1B9 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mrpl28Q9D1B9 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mrpl28Q9D1B9 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Mrpl28Q9D1B9 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Mrpl28Q9D1B9 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mrpl28Q9D1B9 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Mrpl28Q9D1B9 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mrpl28Q9D1B9 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mrpl28Q9D1B9 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mrpl28Q9D1B9 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Mrpl28Q9D1B9 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mrpl28Q9D1B9 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mrpl28Q9D1B9 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mrpl28Q9D1B9 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mrpl28Q9D1B9 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mrpl28Q9D1B9 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mrpl28Q9D1B9 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mrpl28Q9D1B9 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mrpl28Q9D1B9 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mrpl28Q9D1B9 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mrpl28Q9D1B9 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mrpl28Q9D1B9 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mrpl28Q9D1B9 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mrpl28Q9D1B9 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mrpl28Q9D1B9 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mrpl28Q9D1B9 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mrpl28Q9D1B9 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mrpl28Q9D1B9 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mrpl28Q9D1B9 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms